ستاد مشترک ارتش جمهوری اسلامی ایران (سماجا) به عنوان ستاد برتر در ارتش، مرکز برنامه‌ریزی، کنترل و هماهنگی بین هر چهار نیروی ارتش جمهوری اسلامی ایران و سازمان‌های وابسته به ارتش همچون سازمان عقیدتی سیاسی و سازمان حفاظت اطلاعات ارتش می‌باشد. این نیروها شامل نیروی زمینی، نیروی دریایی، نیروی هوایی و قرارگاه پدافند هوایی می‌باشد.
لزوم هماهنگی و پشتیبانی هر سه نیرو از یکدیگر در جنگ‌ها و تهیه دستورالعمل‌های عملیاتی و اداری در زمان صلح باعث به وجود آمدن ستاد مشترک شده است. این ستاد تقریباً در تمامی ارتش‌های منظم دنیا وجود دارد و وظیفه اصلی آن هم ایجاد نظم و هماهنگی و وحدت رویه بین کلیه نیروهای رزمی ارتش می‌باشد. سپهبد قرنی اولین رئیس ستاد مشترک ارتش ایران پس از پیروزی انقلاب ۵۷ بود. با توجه به ایجاد سمت فرماندهی کل در ارتش، عنوان ستاد مشترک ارتش به صورت غیر سازمانی به ستاد آجا تغییر یافته است. جایگاه ریاست ستاد مشترک ارتش به معاونت هماهنگ‌کنندهٔ ارتش تبدیل گردید. ادارات قبلی ستاد مشترک مثل اداره آجودانی، ادارات یکم تا نهم و… از قدیمی‌ترین سازمان‌های نیروهای مسلح به صورت سازمان یافته در ایران هستند که در حال حاضر برخی از آن‌ها به صورت مستقل و یا با تجمیع یکدیگر به معاونت تغییر عنوان داده‌اند. هر یک از این ادارات به صورت تخصصی در حوزه مربوط بر عملکرد نیروها نظارت دارند. در سال ۱۳۶۸ و بعد از پایان جنگ ایران با عراق، ستادی با عنوان ستاد کل نیروهای مسلح تشکیل گردید که نیروهای آن از ارتش، سپاه، وزارت دفاع و نیروی انتظامی تأمین می‌گردد. تا قبل از ایجاد این ستاد، دستورالعمل‌های کلی توسط ستاد مشترک ارتش و با همکاری وزارت دفاع تنظیم و به سایر نیروها و نیز شهربانی و ژاندارمری جهت اجرا ابلاغ می‌گردید، لیکن این اقدام بعد از ایجاد ستاد کل نیروهای مسلح، به این ستاد واگذار گردیده و اقدامات ستاد مشترک به حوزه نیروهای تابعه ارتش محدود گردیده است.
