پپتید

از ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد
پرش به: ناوبری، جستجو

الگو:اشکال در ترجمه مبحث تخصصی

Translation arrow fa.svg این نوشتار یک ترجمه از ویکی‌پدیاهای دیگر است. پيوند به سایر زبان‌ها را در سمت راست-پايين اين صفحه ببينيد.
پپتید
دی پپتید

پـِپتیدها (از واژهٔ یونانی πεπτίδια به معنی :گواردنی کوچک، گوارَک) بسپارهای(پلیمر) کوچکی هستند که از به هم پیوستن اسیدهای آمینه با ترتیب مشخصی تشکیل شده‌اند. پیوند بین هر اسید آمینه با اسید آمینهٔ بعدی پیوند آمید یا پیوند پپتیدی نامیده می‌شود. پروتئین‌ها، مولکول‌های بس‌پپتیدی‌ای (و یا حتی چند زیرواحد بس‌پپتیدی، موسوم به ساختار نوع چهارم) هستند. تمایز بین آن‌ها در این است که پپتیدها رشته‌هایی کوتاه و بس‌پپتیدها (پروتئین‌ها) رشته‌هایی بلند از اسید آمینه هستند.(این تاپیک رو من دارم تکمیل می کنم لطفا یه تاپیک دیگر را تکمیل کنید)

تعریف[ویرایش]

یک تعریف این است که، زنجیره ساخته شده از ترکیب آمینواسیدها به اندازه کافی کوچک باشد، به جای پروتئین، پپتید می گوییم. به هر حال، با ظهور روش های ترکیب بهتر، پپتیدهایی به طول صدها آمینواسید، شامل پرتئین کامل مانند ubiquitin، می توان ساخت.

تعریف دیگر یک خط تقسیم فرضی با تقریبی به طول 50 اسیدآمینه است (برخی از افراد طول کمتری در نظر می گیرند). پپتیدهای طولانی، مانند amyloid beta که به بیماری آلزایمر مربوط می شود را می توان به عنوان پروتئین در نظر گرفت . پروتئین های کوچک همانندinsulin را نیز میتوان به عنوان پپتید در نظر گرفت. پس این تعریف تا حدودی اختیاری است.

انواع پپتید[ویرایش]

در اینجا کلاس های اصلی پپتید، برطبق طریقه ساخت آنها آورده شده است:

پپتیدهای شیر[ویرایش]

پپتیدهای شیر به وسیله شکست آنزیمی توسط آنزیم های گوارشی از پروتئین های شیر به دست می آیند یا هنگام تخمیر شیر توسط باکتری lactobacilli ایجاد می شوند. چندین پپتید شیر، در مطالعات بالینی نشان دادند، که اثرات ضد فشار خون بر روی حیوانات دارند(همچنین ببینید Lactotripeptides ) .

پپتیدهای ریبوزومی[ویرایش]

پپتیدهای ریبوزومی به وسیله ترجمه mRNA ساخته می شوند.آنها اغلب دستمایه پروتئین کافت جهت ساخت شکلهای کاملتر (پروتیینها) هستند. این ترکیبها نوعا در ارگانیسمهای تکامل یافته تر، به عنوان هورمون و مولکولهای علامت رسان یا پیام دهنده عمل می کنند. بعضی از ارگانیسم ها، پپتیدها را به عنوان آنتی بادی تولید می کنند، مثلاmicrocins ا .[۱] . هنگامی که آنها ترجمه میشوند، آمینواسیدهای باقی مانده، توسط ریبوزوم مورد استفاده قرار می گیرند.[۲]. به هر حال، این پپتید ها، بارها تغییر بعد از انتقال دارند، مانند phosphorylation, hydroxylation, sulfonation, palmitylation, glycosylation و ساخت ترکیبات سولفور. در حالت عادی آنها خطی هستند، اگرچه ساختارهای قوسی نیز مشاهده شده اند. کاربرد عجیب دیگر نیز وجوددارد، مانند راسميک شدن L-آمین.اسید به D-آمینواسید در platypus venom ا. [۳]

پپتیدهای غیرریبوزومی[ویرایش]

این پپتیدها به جای ریبوزوم، به وسیله آنزیم هایی که مختص هر پپتید است تولید می شوند[۴]. معروف ترین پپتید غیرریبوزومی glutathione است که جزئی از سیستم ضداکسنده بیشتر ارگانیسم های هوازی است. پپتید غیرریبوزومی معروف دیگر در تک سلولی ها، گیاهان و قارچ ها یافت می شود. [۵] [۶] این پپتیدها اغلب دایره ای هستند و می توانند پیچیدگی ساختاری دایره ای زیادی داشته باشند، اگرچه پپتیدهای غیرریبزومی خطی نیز وجود دارند. [۷]

پپتن[ویرایش]

پپتن از شیر و یا گوشت حیوانات به هنگام تجزیه مشتق می شود. به علاوه برای تولید پپتیدهای کوچک مواد نتیجه شده شامل چربی، فلزات، نمک، ویتامین، وخیلی دیگر از مواد زیستی ترکیب می شوند. پپتن به عنوان واسط تغذیه در باکتری ها و قارچ ها استفاده می شود. [۸]

قطعه های پپتیدی[ویرایش]

قطعه های پپتیدی اجزائی از پروتئین هستند که برای شناسایی یا تعیین کمیت پروتئین مورد استفاده قرار می گیرند. اغلب اینها محصولات تجزیه آنزیمی است که در آزمایشگاه تحت کنترل انجام می شود، اما می تواند از تجزیه طبیعی فسیل و یا چیزهای دیگر حاصل شود. [۹] [۱۰][۱۱]

ترکیب پپتیدها[ویرایش]

همچنین ببینید ترکیب پپتیدها

Table of amino acids
مسیر ثابت در ترکیب پپتید ها

پپتیدها در بیولوژی مولکولی[ویرایش]

پپتیدها اخیرا به چند دلیل در بیولوژی مولکولی به جایگاه ویژه ای رسیده اند. اول اینکه پپتیدها اجازه تولید آنتی بادی پپتید در حیوانات بدون نیاز به پالایش پروتئین مورد نظر را می دهند. از این مورد برای ساختن آنتی بادی در خرگوش یا موش در برابر پروتئین، استفاده می شود. [۱۲]

دلیل دیگراین است که پپتید در اندازه گیری طیف سنجی جرمی مفید است. اجازه مشخص سازی جرم پروتئینی که بر پایه پپتید است را، می دهد. در این مورد پپتیدها اغلب با محلول گوارش بعد از جداسازی ذرات الکتروفورز از پروتئین، تولید می شود.[۱۳]

پپتید اخیرا برای مطالعه ساختار و توابع پروتئین، استفاده شده است. برای مثال، ترکیب پپتیدها می تواند جهت تحقیق در مورد فهمیدن اینکه کجا تعامل بین پروتئین و پپتید اتفاق می افتد، استفاده کرد. سولفور عنصری است که در تعدادی از چند-پپتیدها، وجود دارد.

پپتیدهای بازداشتی، در تحقیقات بالینی، برای تست تاثیر پپتید بر پروتئین های سرطان و دیگر بیماری ها استفاده می شود.

پپتیدهای معروف در انسان[ویرایش]

خانواده پپتیدهای در این قسمت، پپتیدهای ریبوزومی هستند، معمولا با فعالیت هورمونی. آنها در جایی که علائم تابع آنها فعال شود در رگهای خونی، رها می شوند.

  1. انواع پپتیدها
    1. The Tachykinin peptides
    2. Vasoactive intestinal peptides
    3. Pancreatic polypeptide-related peptides
    4. Opioid peptides
    5. Calcitonin peptides


نقش پپتیدها در گرسنگی و سیری[ویرایش]

پپتیدها معدی-روده‌ای در سیری و گرسنگی نقش ایفا می کنند.

پپتیدهای سیری[ویرایش]

غذای هضم شده با گیرنده های تارهای معدی روده‌ای تعامل می کنند و نتیجه ی این تعامل، آزاد شدن پپتیدها در جریان خون است. ده‌ها پپتید( از جمله کوله‌سیستوکینین(CCK)،گلوکاگون، بومبزین، هورمون محرک آلفا ملانوسیت و سوماتوستاتین) مقدار غذا خوردن را کم می کنند. به ویژه دوز بسیار پایین از کوله‌سیستوکینین، اشتها و خوردن را کم می کند و بنابراین می توان آنرا «پپتید سیری»(یا پپتیدی که اشتها را کم می کند.) در نظر گرفت.[۱۴][۱۵][۱۶][۱۷]

پپتیدهای گرسنگی[ویرایش]

این پپتیدها اشتها را زیاد میکنند. این پپتیدها در مغز به ویژه هیپوتالاموس ساخته می‌شوند[۱۸]. معروف ترین آنها عبارتند از[۱۹]: پپتید عصبی Y، گالانین، اورکسین A و گرلین

منابع[ویرایش]

  1. Duquesne S, Destoumieux-Garzón D, Peduzzi J, Rebuffat S (August 2007). "Microcins, gene-encoded antibacterial peptides from enterobacteria". Natural Product Reports 24 (4): 708–34. doi:10.1039/b516237h. PMID 17653356. 
  2. Pons M, Feliz M, Antònia Molins M, Giralt E (May 1991). "Conformational analysis of bacitracin A, a naturally occurring lariat". Biopolymers 31 (6): 605–12. doi:10.1002/bip.360310604. PMID 1932561. 
  3. Torres AM, Menz I, Alewood PF, et al. (July 2002). "D-Amino acid residue in the C-type natriuretic peptide from the venom of the mammal, Ornithorhynchus anatinus, the Australian platypus". FEBS Letters 524 (1-3): 172–6. doi:10.1016/S0014-5793(02)03050-8. PMID 12135762. 
  4. Meister A, Anderson ME (1983). "Glutathione". Annual Review of Biochemistry 52 (1): 711–60. doi:10.1146/annurev.bi.52.070183.003431. PMID 6137189. 
  5. Hahn M, Stachelhaus T (November 2004). "Selective interaction between nonribosomal peptide synthetases is facilitated by short communication-mediating domains". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 101 (44): 15585–90. doi:10.1073/pnas.0404932101. PMC 524835. PMID 15498872. 
  6. Finking R, Marahiel MA (2004). "Biosynthesis of nonribosomal peptides1". Annual Review of Microbiology 58 (1): 453–88. doi:10.1146/annurev.micro.58.030603.123615. PMID 15487945. 
  7. Du L, Shen B (March 2001). "Biosynthesis of hybrid peptide-polyketide natural products". Current Opinion in Drug Discovery & Development 4 (2): 215–28. PMID 11378961. 
  8. Payne JW (1976). "Peptides and micro-organisms". Advances in Microbial Physiology 13: 55–113. doi:10.1016/S0065-2911(08)60038-7. PMID 775944. 
  9. Hummel J, Niemann M, Wienkoop S, et al. (2007). "ProMEX: a mass spectral reference database for proteins and protein phosphorylation sites". BMC Bioinformatics 8: 216. doi:10.1186/1471-2105-8-216. PMC 1920535. PMID 17587460. 
  10. Webster J, Oxley D (2005). "Peptide mass fingerprinting: protein identification using MALDI-TOF mass spectrometry". Methods in Molecular Biology 310: 227–40. doi:10.1007/978-1-59259-948-6_16. PMID 16350956. 
  11. Marquet P, Lachâtre G (October 1999). "Liquid chromatography-mass spectrometry: potential in forensic and clinical toxicology". Journal of Chromatography. B, Biomedical Sciences and Applications 733 (1-2): 93–118. doi:10.1016/S0378-4347(99)00147-4. PMID 10572976. 
  12. Bulinski JC (1986). "Peptide antibodies: new tools for cell biology". International Review of Cytology 103: 281–302. doi:10.1016/S0074-7696(08)60838-4. PMID 2427468. 
  13. C.Michael Hogan. 2011. sulfur. Encyclopedia of Earth, eds. Andy Jorgensen and C.J.Cleveland, National Council for Science and the environment, Washington DC
  14. beck,2001
  15. halford and Blundell, 2000
  16. Strubbe and Van Dijk, 2002
  17. Ritter, 2004
  18. روان‌شناسی فیزیولوژیک- جان پینل -ویراست چهارم2007- مهرداد فیروزبخت- نشر ویرایش- چاپ اول 1387-ص 406
  19. روان‌شناسی فیزیولوژیک- جان پینل -ویراست چهارم2007- مهرداد فیروزبخت- نشر ویرایش- چاپ اول 1387-ص 406

مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا، «Peptide»، ویکی‌پدیای انگلیسی، دانشنامهٔ آزاد (بازیابی در ۶ اکتبر ۲۰۰۸).