معمولاً نگه‌داری و آماده‌سازی نامناسب مواد غذایی علت شایع مسمومیت غذایی می‌باشد.
باکتری‌ها علت شایع مسمومیت غذایی هستند. در سال ۲۰۰۰ نسبت باکتری‌های ایجادکننده مسمومیت به صورت زیر بود. کامپیلوباکتر ژژونی، حدود ۷۷٫۰۳ درصد، سالمونلا، ۲۰٫۹ درصد و اشریشیا کولی، ۱٫۴ درصد و بقیه باکتری‌ها کمتر از نیم درصد گزاش شد.[۱]
بیشتر بیماری‌های معلول غذا، عفونت‌های ناشی از انواع باکتری‌ها، ویروس ها و انگل‌ها هستند. سایر مسمومیت‌ها ناشی از سموم مضر یا مواد شیمیایی هستند که مواد غذایی را آلوده میکنند.[۲]
