مونو نگا ویرالس: تفاوت میان نسخهها
ایجاد شده بهواسطهٔ ترجمهٔ صفحهٔ «Mononegavirales» |
(بدون تفاوت)
|
نسخهٔ ۲۸ فوریهٔ ۲۰۲۲، ساعت ۰۲:۰۶
مونو نگا ویرالس دستهای از ویروسهای آر ان ای رشته منفی است که دارای ژنوم غیرقطعی هستند. برخی از اعضای رایج این راسته عبارتند از: ویروس ابولا، ویروس سنسیشیال تنفسی انسانی، ویروس سرخک، ویروس اوریون، ویروس نیپا و ویروس هاری . همه این ویروس ها باعث بیماری قابل توجهی در انسان می شوند. بسیاری از پاتوژن های مهم دیگر حیوانات و گیاهان غیرانسانی نیز در این گروه قرار دارند. این ترتیب شامل یازده خانواده ویروس است : Artoviridae ، Boآرانایviridae ، Filoviridae ، Lispiviridae ، Mymonaviridae ، Nyamiviridae ، Paramyxoviridae ، Pneumoviridae ، Rhabdoviridae ، Sunviridae ، و XXI . [۱]
استفاده از اصطلاح
راسته Mononegavirales (تلفظ: /ˌmɒnəˌnɛɡəviˈrɑːlɪz/ MON-ə-NEG-ə-vee-RAH-liz ) [note ۱] [۲] [۳] یک تاکسون ویروس شناسی است که در سال 1991 ایجاد شد [۴] و در 1995، 1997، [۵] 2000، 2005، 2011، 2016، [۶] 2017 اصلاح شد، [۷] و 2018. [۱] نام Mononegavirales از صفت یونانی باستان μóνος monos (که اشاره به ژنوم تکجانبی و تک رشتهای اکثر تکنگاویروسها)، فعل لاتین negare (که اشاره به قطبیت منفی این ژنومها دارد) و پسوند طبقهبندی -virales گرفته شده است. یک سفارش ویروسی). [۳]
معیارهای درج سفارش
یک ویروس عضوی از راسته Mononegavirales است اگر [۳]
- ژنوم آن یک آرانای خطی، به طور معمول (اما نه همیشه) بدون قطعه، تک رشته ای و غیر عفونی با قطبیت منفی است. دارای انتهای 3' و 5' مکمل معکوس است. و به طور کووالانسی به پروتئینی مرتبط نیست.
- ژنوم آن دارای مرتبه ژنی مشخصه 3'-UTR - ژن های پروتئین هسته - ژن های پروتئین پوششی - ژن آرانای پلیمراز وابسته به آرانای - 5'-UTR (3'-NPMGL-5') است (البته استثناهایی وجود دارد).
- 5 تا 10 mآرانای متمایز از ژنوم خود را از طریق رونویسی متوالی قطبی از یک پروموتر منفرد واقع در انتهای '3 ژنوم تولید می کند. mآرانای ها 5' پوشیده و پلی آدنیله هستند.
- با سنتز آنتی ژنوم کامل تکثیر می شود.
- ریبونوکلئوکپسیدهای مارپیچ عفونی را به عنوان الگوهایی برای سنتز mآرانای ها، آنتی ژنوم ها و ژنوم ها تشکیل می دهد.
- این یک آرانای پلیمراز وابسته به آرانای (آردی آر پی، L) را کد می کند که بسیار همولوگ با سایر مونونگا ویروس ها است. و/یا
- معمولاً (اما نه همیشه) ویریون پوششی با جرم مولکولی ×۱۰۶ 106 تولید می کند. یک S 20W 550–>1045; و چگالی شناور در CsCl از 1.18-1.22 g/cm 3 .
چرخه زندگی
چرخه زندگی مونونگا ویروس با اتصال ویریون به گیرندههای سطح سلولی خاص آغاز میشود و به دنبال آن ادغام پوشش ویریون با غشای سلولی و انتشار همزمان نوکلئوکپسید ویروس در سیتوزول انجام میشود. ویروس آردی آر پی تا حدی نوکلئوکپسید را می پوشاند و ژن ها را به mآرانای های رشته ای مثبت رونویسی می کند، که سپس به پروتئین های ساختاری و غیرساختاری ترجمه می شوند.
Mononegavirus آردی آر پیs به یک پروموتور منفرد که در انتهای 3' ژنوم قرار دارد متصل می شود. رونویسی یا پس از یک ژن خاتمه می یابد یا به ژن بعدی در پایین دست ادامه می یابد. این به این معنی است که ژنهای نزدیک به انتهای 3 ژنوم با بیشترین فراوانی رونویسی میشوند، در حالی که ژنهایی که در انتهای 5 هستند کمترین احتمال رونویسی را دارند. بنابراین ترتیب ژن یک شکل ساده اما مؤثر از تنظیم رونویسی است. فراوان ترین پروتئین تولید شده، نوکلئوپروتئین است که غلظت آن در سلول تعیین می کند که آردی آر پی از رونویسی ژن به همانندسازی ژنوم تغییر کند.
همانندسازی منجر به آنتی ژنوم های تمام قد و رشته مثبت می شود که به نوبه خود به نسخه های ژنوم نسل ویروس رشته منفی رونویسی می شوند. پروتئینهای ساختاری و ژنومهای تازه سنتز شده خود به خود جمع میشوند و در نزدیکی داخل غشای سلولی تجمع مییابند. ویریون ها از سلول جوانه می زنند و پوشش خود را از غشای سلولی که از آن جوانه می زنند به دست می آورند. سپس ذرات نتاج بالغ سلول های دیگر را برای تکرار چرخه آلوده می کنند.
پالئوویروسولوژی
مونونگا ویروس ها سابقه ای دارند که به چندین ده میلیون سال قبل باز می گردد. فسیلهای مونونگا ویروس به شکل ژنهای مونونگا ویروس یا قطعات ژنی ادغام شده در ژنوم پستانداران کشف شدهاند. به عنوان مثال، "فسیلهای" ژن بورناویروس در ژنوم خفاشها ، ماهیها ، هیراکسها ، کیسهداران ، نخستیسانان ، جوندگان ، نشخوارکنندگان و فیلها شناسایی شدهاند. [۸] [۹] [۱۰] [۱۱] [۱۲] «فسیلهای» ژن فیلوویروس در ژنوم خفاشها، جوندگان، سوهان، تنرکها و کیسهداران شناسایی شده است. [۹] [۱۰] [۱۳] [۱۴] یک "فسیل" ویروس Midway در ژنوم گورخرماهی یافت شد. [۹] در نهایت، فسیل های رابدویروس در ژنوم سخت پوستان، پشه ها ، کنه ها و گیاهان یافت شد. [۱۵] [۱۰] [۱۶] [۱۷]
طبقه بندی
یادداشت
- ↑ According to the rules for taxon naming established by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), the name Mononegavirales is always to be capitalized, italicized, and never abbreviated. The names of the order's physical members ("mononegaviruses" or "mononegavirads") are to be written in lower case, are not italicized, and used without articles.
منابع
لینک های خارجی
- ↑ ۱٫۰ ۱٫۱ Amarasinghe GK, Aréchiga Ceballos NG, Banyard AC, Basler CF, Bavari S, Bennett AJ, Blasdell KR, Briese T, Bukreyev A, Caì Y, Calisher CH, Campos Lawson C, Chandran K, Chapman CA, Chiu CY, Choi KS, Collins PL, Dietzgen RG, Dolja VV, Dolnik O, Domier LL, Dürrwald R, Dye JM, Easton AJ, Ebihara H, Echevarría JE, Fooks AR, Formenty PB, Fouchier RA, Freuling CM, Ghedin E, Goldberg TL, Hewson R, Horie M, Hyndman TH, Jiāng D, Kityo R, Kobinger GP, Kondō H, Koonin EV, Krupovic M, Kurath G, Lamb RA, Lee B, Leroy EM, Maes P, Maisner A, Marston DA, Mor SK, Müller T, Mühlberger E, Ramírez VM, Netesov SV, Ng TF, Nowotny N, Palacios G, Patterson JL, Pawęska JT, Payne SL, Prieto K, Rima BK, Rota P, Rubbenstroth D, Schwemmle M, Siddell S, Smither SJ, Song Q, Song T, Stenglein MD, Stone DM, Takada A, Tesh RB, Thomazelli LM, Tomonaga K, Tordo N, Towner JS, Vasilakis N, Vázquez-Morón S, Verdugo C, Volchkov VE, Wahl V, Walker PJ, Wang D, Wang LF, Wellehan JF, Wiley MR, Whitfield AE, Wolf YI, Yè G, Zhāng YZ, Kuhn JH (April 2018). "Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2018". Archives of Virology. 163 (8): 2283–2294. doi:10.1007/s00705-018-3814-x. PMC 6076851. PMID 29637429.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|displayauthors=
ignored (|display-authors=
suggested) (help) - ↑ خطای یادکرد: خطای یادکرد:برچسب
<ref>
غیرمجاز؛ متنی برای یادکردهای با نامKing2011
وارد نشده است. (صفحهٔ راهنما را مطالعه کنید.). - ↑ ۳٫۰ ۳٫۱ ۳٫۲ Kuhn JH, Becker S, Ebihara H, Geisbert TW, Johnson KM, Kawaoka Y, Lipkin WI, Negredo AI, Netesov SV, Nichol ST, Palacios G, Peters CJ, Tenorio A, Volchkov VE, Jahrling PB (December 2010). "Proposal for a revised taxonomy of the family Filoviridae: classification, names of taxa and viruses, and virus abbreviations". Archives of Virology. 155 (12): 2083–103. doi:10.1007/s00705-010-0814-x. PMC 3074192. PMID 21046175.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|displayauthors=
ignored (|display-authors=
suggested) (help) - ↑ Pringle, C. R. (1991). "The order Mononegavirales". Archives of Virology. 117 (1–2): 137–40. doi:10.1007/BF01310499. PMID 2006902.
- ↑ Pringle CR (1997). "The order Mononegavirales--current status". Archives of Virology. 142 (11): 2321–6. PMID 9672597.
- ↑ Afonso CL, Amarasinghe GK, Bányai K, Bào Y, Basler CF, Bavari S, Bejerman N, Blasdell KR, Briand FX, Briese T, Bukreyev A, Calisher CH, Chandran K, Chéng J, Clawson AN, Collins PL, Dietzgen RG, Dolnik O, Domier LL, Dürrwald R, Dye JM, Easton AJ, Ebihara H, Farkas SL, Freitas-Astúa J, Formenty P, Fouchier RA, Fù Y, Ghedin E, Goodin MM, Hewson R, Horie M, Hyndman TH, Jiāng D, Kitajima EW, Kobinger GP, Kondo H, Kurath G, Lamb RA, Lenardon S, Leroy EM, Li CX, Lin XD, Liú L, Longdon B, Marton S, Maisner A, Mühlberger E, Netesov SV, Nowotny N, Patterson JL, Payne SL, Paweska JT, Randall RE, Rima BK, Rota P, Rubbenstroth D, Schwemmle M, Shi M, Smither SJ, Stenglein MD, Stone DM, Takada A, Terregino C, Tesh RB, Tian JH, Tomonaga K, Tordo N, Towner JS, Vasilakis N, Verbeek M, Volchkov VE, Wahl-Jensen V, Walsh JA, Walker PJ, Wang D, Wang LF, Wetzel T, Whitfield AE, Xiè JT, Yuen KY, Zhang YZ, Kuhn JH (August 2016). "Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2016". Archives of Virology. 161 (8): 2351–60. doi:10.1007/s00705-016-2880-1. PMC 4947412. PMID 27216929.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|displayauthors=
ignored (|display-authors=
suggested) (help) - ↑ Amarasinghe GK, Bào Y, Basler CF, Bavari S, Beer M, Bejerman N, Blasdell KR, Bochnowski A, Briese T, Bukreyev A, Calisher CH, Chandran K, Collins PL, Dietzgen RG, Dolnik O, Dürrwald R, Dye JM, Easton AJ, Ebihara H, Fang Q, Formenty P, Fouchier RA, Ghedin E, Harding RM, Hewson R, Higgins CM, Hong J, Horie M, James AP, Jiāng D, Kobinger GP, Kondo H, Kurath G, Lamb RA, Lee B, Leroy EM, Li M, Maisner A, Mühlberger E, Netesov SV, Nowotny N, Patterson JL, Payne SL, Paweska JT, Pearson MN, Randall RE, Revill PA, Rima BK, Rota P, Rubbenstroth D, Schwemmle M, Smither SJ, Song Q, Stone DM, Takada A, Terregino C, Tesh RB, Tomonaga K, Tordo N, Towner JS, Vasilakis N, Volchkov VE, Wahl-Jensen V, Walker PJ, Wang B, Wang D, Wang F, Wang LF, Werren JH, Whitfield AE, Yan Z, Ye G, Kuhn JH (August 2017). "Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2017". Archives of Virology. 162 (8): 2493–2504. doi:10.1007/s00705-017-3311-7. PMC 5831667. PMID 28389807.
{{cite journal}}
: Unknown parameter|displayauthors=
ignored (|display-authors=
suggested) (help) - ↑ Horie M, Honda T, Suzuki Y, Kobayashi Y, Daito T, Oshida T, Ikuta K, Jern P, Gojobori T, Coffin JM, Tomonaga K (January 2010). "Endogenous non-retroviral RNA virus elements in mammalian genomes". Nature. 463 (7277): 84–7. Bibcode:2010Natur.463...84H. doi:10.1038/nature08695. PMC 2818285. PMID 20054395.
- ↑ ۹٫۰ ۹٫۱ ۹٫۲ Belyi VA, Levine AJ, Skalka AM (July 2010). Buchmeier MJ (ed.). "Unexpected inheritance: multiple integrations of ancient bornavirus and ebolavirus/marburgvirus sequences in vertebrate genomes". PLOS Pathogens. 6 (7): e1001030. doi:10.1371/journal.ppat.1001030. PMC 2912400. PMID 20686665.
- ↑ ۱۰٫۰ ۱۰٫۱ ۱۰٫۲ Katzourakis A, Gifford RJ (November 2010). Malik HS (ed.). "Endogenous viral elements in animal genomes". PLOS Genetics. 6 (11): e1001191. doi:10.1371/journal.pgen.1001191. PMC 2987831. PMID 21124940.
- ↑ Cui J, Wang LF (November 2015). "Genomic Mining Reveals Deep Evolutionary Relationships between Bornaviruses and Bats". Viruses. 7 (11): 5792–800. doi:10.3390/v7112906. PMC 4664979. PMID 26569285.
- ↑ Horie M, Tomonaga K (April 2018). "Paleovirology of bornaviruses: What can be learned from molecular fossils of bornaviruses". Virus Research. 262: 2–9. doi:10.1016/j.virusres.2018.04.006. PMID 29630909.
- ↑ Taylor DJ, Leach RW, Bruenn J (June 2010). "Filoviruses are ancient and integrated into mammalian genomes". BMC Evolutionary Biology. 10: 193. doi:10.1186/1471-2148-10-193. PMC 2906475. PMID 20569424.
- ↑ Taylor DJ, Dittmar K, Ballinger MJ, Bruenn JA (November 2011). "Evolutionary maintenance of filovirus-like genes in bat genomes". BMC Evolutionary Biology. 11: 336. doi:10.1186/1471-2148-11-336. PMC 3229293. PMID 22093762.
- ↑ Metegnier G, Becking T, Chebbi MA, Giraud I, Moumen B, Schaack S, Cordaux R, Gilbert C (2015). "Comparative paleovirological analysis of crustaceans identifies multiple widespread viral groups". Mobile DNA. 6: 16. doi:10.1186/s13100-015-0047-3. PMC 4573495. PMID 26388953.
- ↑ Chiba S, Kondo H, Tani A, Saisho D, Sakamoto W, Kanematsu S, Suzuki N (July 2011). Nagy PD (ed.). "Widespread endogenization of genome sequences of non-retroviral RNA viruses into plant genomes". PLOS Pathogens. 7 (7): e1002146. doi:10.1371/journal.ppat.1002146. PMC 3136472. PMID 21779172.
- ↑ Fort P, Albertini A, Van-Hua A, Berthomieu A, Roche S, Delsuc F, Pasteur N, Capy P, Gaudin Y, Weill M (January 2012). "Fossil rhabdoviral sequences integrated into arthropod genomes: ontogeny, evolution, and potential functionality". Molecular Biology and Evolution. 29 (1): 381–90. doi:10.1093/molbev/msr226. PMID 21917725.