آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر

از ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد
Cold Spring Harbor Laboratory
Cold Spring Harbor Laboratory logo.png
بنیان‌گذاری‌شده۱۸۹۰
رئیسبروس استیلمن
کارکنان۱٬۲۰۰
بودجه$۱۵۰٬۰۰۰٬۰۰۰
مکان
جاده ۱ بانگتاون
، ، ،
وبگاهwww.cshl.edu
Cold Spring Harbor Laboratory Historic District
آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر در نیویورک قرار گرفته‌است
آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر
آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر در ایالات متحده آمریکا قرار گرفته‌است
آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر
موقعیتJct. of NY 25A and Bungtown Rd. , Laurel Hollow, New York
مختصات۴۰°۵۱′۳۰″ شمالی ۷۳°۲۸′۰۰″ غربی / ۴۰٫۸۵۸۳۳°شمالی ۷۳٫۴۶۶۶۷°غربی / 40.85833; -73.46667مختصات: ۴۰°۵۱′۳۰″ شمالی ۷۳°۲۸′۰۰″ غربی / ۴۰٫۸۵۸۳۳°شمالی ۷۳٫۴۶۶۶۷°غربی / 40.85833; -73.46667
مساحت۱۰۰ جریب فرنگی (۴۰ هکتار)
معمارMultiple
سبک معماریMultiple
منبع NRHP94000198[۱]
اضافه شده به NRHP۳۰ مارس ۱۹۹۴
آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر

آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر (Cold Spring Harbor) به اختصار CSHL یکی از معتبرترین موسسات خصوصی تحقیقاتی با تمرکز بر ژنومیک، سرطان، علوم اعصاب، زیست‌شناسی گیاهی، و زیست‌شناسی محاسباتی است.[۲]

این آزمایشگاه یکی از معروف‌ترین موسساتی است که نقش مهمی در توسعه ژنتیک مولکولی و زیست‌شناسی مولکولی ایفا کرده‌است.[۳]

هشت برنده جایزه نوبل پزشکی یا فیزیولوژی از افراد وابسته به این آزمایشگاه بوده‌اند. بر اساس داده‌های تامسون رویترز، CSHL به عنوان یکی از پیشروترین موسسات تحقیقاتی زیست‌شناسی مولکولی و ژنتیک رده‌بندی می‌شود.[۴] همچنین طبق نتایج نشریه نیچر، CSHL رتبه یک تولید علم در جهان را در اختیار دارد.[۵] این آزمایشگاه توسط بروس استیلمن، بیوشیمیست و محقق سرطان اداره می‌شود.

برنامه‌های تحقیقاتی[ویرایش]

بیش از ۶۰۰ نفر کارمند تحقیقاتی از جمله محققان فوق دکترا در ۵۲ آزمایشگاه CSHL، تعداد ۱۲۵ دانشجوی تحصیلات تکمیلی و ۵۰۰ پرسنل اداری، کل کارمندان را به بیش از ۱۲۰۰ نفر می‌رساند.[۶]

زیست‌شناسی سلولی و ژنومیک RNA مداخله گر و زیست‌شناسی میکروRNAها؛ تکثیر DNA؛ پیرایش RNA؛ هدایت سیگنال؛ ساختار ژنوم؛ RNAهای غیر کد کننده؛ توالی یابی عمیق؛ توالی یابی و تجزیه و تحلیل تک سلولی؛ سلول‌های بنیادی؛ دینامیک کروماتین؛ زیست‌شناسی ساختاری؛ پروتئومیکس پیشرفته؛ طیف‌سنجی جرمی؛ میکروسکوپی پیشرفته.

تحقیق سرطان انواع اصلی سرطان تحت مطالعه: پستان، پروستات، خون (لوسمی، لنفوم). سندرم میلوددیپلاستیک ملانوما؛ کبد؛ تخمدان و دهانه رحم؛ ریه؛ مغز؛ لوزالمعده.

کانون‌های تحقیقاتی: مقاومت در برابر دارو؛ ژنتیک سرطان؛ ریز محیط تومور. متابولیسم سرطان؛ کنترل رشد در سلول‌های پستانداران؛ تنظیم ژن رونویسی و پس از رونویسی.

علوم اعصاب انستیتوی ژنومیک شناختی استنلی از تکنیک‌های توالی یابی عمیق و سایر ابزارها برای مطالعه ژنتیک اساس اختلالاتی مانند اسکیزوفرنی، اختلال دو قطبی و افسردگی استفاده می‌کند.

مرکز مکانیسم‌های عصبی Swartz ،شناخت در مغز عادی را به عنوان پایه ای برای درک اختلالات در بیماری‌های عصبی بررسی می‌کند.

سایر کانون‌های تحقیقاتی شامل ژنتیک اوتیسم؛ نقشه‌برداری از مغز پستانداران؛ ارتباطات عصبی در تصمیم‌گیری.

زیست‌شناسی گیاهی[۷] توالی یابی ژنوم گیاهان، اپی ژنتیک و سلولهای بنیادی، پیام رسانی سلول‌های بنیادی. تعامل بین گیاهان و محیط زیست؛ استفاده از بینش‌های ژنتیکی برای افزایش عملکرد محصولات زراعی، به عنوان مثال ذرت، برنج، گندم. افزایش کیفیت و تولید میوه در گیاهان گلدار؛ به عنوان مثال، گوجه فرنگی. ژنتیک گیاهان آبزی برای توسعه سوخت‌های زیستی.

مرکز زیست‌شناسی محاسباتی سایمون بازسازی توالی و اعتبار سنجی ژنوم؛ مدل‌سازی ریاضی و توسعه الگوریتم؛ ژنتیک جمعیت؛ آمار کاربردی و یادگیری ماشین؛ ژنتیک محاسباتی؛ رایانش ابری و کلان‌داده.

کووید ۱۹[ویرایش]

دانشمندان آزمایشگاه CSHL، دانشگاه بهداشت یوتا، مؤسسه درمانی PEEL، دانشکده پزشکی ویل کرنل برای بررسی عملکرد احتمالی تله‌های خارج سلولی نوتروفیل (NET) در COVID-19، از ۳۳ فرد بستری در بیمارستان نمونه‌گیری کردند. تله‌های خارج سلولی نوتروفیل (NET) نوعی عامل محافظتی بوده که توسط سیستم ایمنی بدن در برابر برخی عوامل بیماری‌زا استفاده می‌شوند.[۸]

برنامه‌های آموزشی[ویرایش]

ورودی بلوار 500 Sunnyside.

علاوه بر اهمیت در بخش‌های تحقیقاتی، CSHL مأموریت آموزشی گسترده‌ای نیز دارد. مدرک دکتری توسط دانشکده علوم زیست‌شناسی واتسون (WSBS)، که در سال ۱۹۹۸ تأسیس شد، اعطا می‌شود. آزمایشگاه و اعضای هیئت علمی به‌طور کامل بودجه برنامه تحقیقاتی هر دانشجو را تأمین می‌کنند. دانشجویان برای به دست آوردن مدرک دکترای خود در ۴–۵ سال به چالش کشیده می‌شوند.

مطبوعات آزمایشگاه کولد اسپرینگ هاربر برنامه ای را متشکل از هفت ژورنال علمی، ۱۹۰ کتاب، کتابچه و پروتکل‌های راهنمای آزمایشگاهی و خدمات آنلاین برای نسخه‌های پیش از انتشار تحقیقاتی ایجاد کرده‌است.[۹]

منابع مالی[ویرایش]

در سال ۲۰۱۵، CSHL بودجه ای بیش از ۱۵۰ میلیون دلار در اختیار داشت که بیش از ۱۰۰ میلیون دلار آن برای تحقیقات هزینه شده‌است.[۱۰] نیمی از این بودجه تحقیقاتی به سرطان اختصاص یافته‌است. ۲۵٪ به علوم اعصاب؛ ۱۵٪ به ژنومیک و زیست‌شناسی محاسباتی و ۱۰٪ برای علوم گیاهی.

تحقیقات معاصر[ویرایش]

  • در سال ۱۹۷۳، ریچارد جی رابرتز توسعه آنزیم‌های محدود کننده، ابزارهای اساسی زیست‌شناسی مولکولی را آغاز می‌کند.[۱۱]
  • در سال ۱۹۸۱ مایکل ویگلر H-RAS، اولین ژن ایجاد کننده سرطان یا انکوژن را کشف کرد.
  • در سال ۱۹۸۸ اد هارلو نشان داد که ژن‌های ایجاد کننده سرطان و پیشگیری از سرطان (ژن‌های انکوژن و سرکوب کننده تومور) با یکدیگر در تعامل هستند.[۱۲]
  • در سال ۱۹۹۴، بروس استیلمن همانندسازی DNA را در یک لوله آزمایش مجدداً بازسازی می‌کند.[۱۳]
  • در سال ۲۰۰۲، تیم گرگوری هانون فناوری را برای تولید کتابخانه‌های آران‌ای کوچک سنجاق‌سری ایجاد می‌کند که به محققان این امکان را می‌دهد تا ژن‌ها را در سلول‌های زنده روشن یا خاموش کنند.[۱۴]
  • در سال ۲۰۰۴، ویگلر و جاناتان سبت متوجه می‌شوند که افزایش و حذف مواد ژنتیکی که به نام تنوع تعداد کپی شناخته می‌شود در بین جمعیت بشر متداول است.[۱۵]
  • در سال ۲۰۰۷، ویگلر و جاناتان سبت دریافتند که جهش‌های خودبخودی یا de novo در مبتلایان به اوتیسم مشاهده می‌شود.[۱۶]
  • در سال ۲۰۰۷، هانون، هادجز، ژوان و مک کامبی فناوری‌هایی را برای توالی یابی اگزوم توسعه دادند.[۱۷]
  • در سال ۲۰۱۱، ویگلر، جیمز هیکس و نیک ناوین اولین مشخصات ژنومی سلول‌های سرطانی منفرد را از تومور یک بیمار انجام می‌دهند.[۱۸]
  • در سال ۲۰۱۱، کریستوفر واکوک یک هدف اصلی دارویی جدید، ژن BRD4، را برای یک نوع کشنده لوسمی حاد میلوژن (AML) کشف می‌کند.[۱۹]
  • در سال ۲۰۱۴، آزمایش‌های فاز ۳ برای استفاده از دارو برای درمان آتروفی عضلانی ستون فقرات (SMA)، یک بیماری عصبی شروع می‌شود.[۲۰]
  • در سال ۲۰۱۷، پاول و هوانگ کشف کردند که هویت بیولوژیکی نورون‌ها در نحوه رونویسی آنها رمزگذاری شده‌است[۲۱]
  • در سال ۲۰۲۰، لینگبو ژانگ و اسکات لاو اعتیاد به ویتامین B6 را در لوسمی میلوئید حاد کشف کردند و کیناز پیریدوکسالی را به عنوان هدف دارویی جدید معرفی کردند.[۲۲]

برندگان جوایز نوبل[ویرایش]

جستارهای وابسته[ویرایش]

منابع[ویرایش]

  1. سازمان پارک‌های ملی (2009-03-13). "National Register Information System". National Register of Historic Places. National Park Service.
  2. "Archived copy". Archived from the original on 2014-03-14. Retrieved 2014-03-14.
  3. Horace Freedland Judson, The Eighth Day of Creation: The Makers of the Revolution in Biology (Simon & Schuster, 1979), esp. pp. 65-69; also: 44-46; 53; 57-58; 62; 70; 82; 185; 232; 239; 247; 273; 321; 368; 392; 454; 458-59; 572-73.
  4. See Thompson Reuters Essential Science Indicators,. The ranking is based on average citation frequency of faculty research papers published between January 2002 and December 2012. (96.94 citations of each CSHL paper, average.)
  5. "Top 10 academic institutions in 2018: normalized". Nature. 2019-06-19. doi:10.1038/d41586-019-01924-x.
  6. "Archived copy" (PDF). Archived from the original (PDF) on 2015-09-23. Retrieved 2014-03-21.
  7. "Plant Biology - Cold Spring Harbor Laboratory". Cold Spring Harbor Laboratory. Retrieved 2018-08-08.
  8. "New evidence for how blood clots may form in very ill COVID-19 patients". Cision PR Newswire. 29 June 2020. Retrieved 21 July 2020.
  9. WebServices. "CSHL Facts & Figures - About Us". Archived from the original on 2014-03-22. Retrieved 2014-03-14.
  10. "Archived copy" (PDF). Archived from the original (PDF) on 2015-09-23. Retrieved 2014-03-21.
  11. Roberts, RJ (1976). "Restriction endonucleases". CRC Crit. Rev. Biochem. 4 (2): 123–64. doi:10.3109/10409237609105456. PMID 795607.
  12. Whyte, P; Buchkovich, KJ; Horowitz, JM; Friend, SH; Raybuck, M; Weinberg, RA; Harlow, E (1988). "Association between an oncogene and an anti-oncogene: the adenovirus E1A proteins bind to the retinoblastoma gene product". Nature. 334 (6178): 124–9. Bibcode:1988Natur.334..124W. doi:10.1038/334124a0. PMID 2968522.
  13. Waga, S; Bauer, G; Stillman, B (April 1994). "Reconstitution of complete SV40 DNA replication with purified replication factors". J. Biol. Chem. 269 (14): 10923–34. PMID 8144677.
  14. Paddison, PJ; Caudy, AA; Bernstein, E; Hannon, GJ; Conklin, DS (April 2002). "Short hairpin RNAs (shRNAs) induce sequence-specific silencing in mammalian cells". Genes Dev. 16 (8): 948–58. doi:10.1101/gad.981002. PMC 152352. PMID 11959843.
  15. Sebat, J; Lakshmi, B; Troge, J; et al. (July 2004). "Large-scale copy number polymorphism in the human genome". Science. 305 (5683): 525–8. Bibcode:2004Sci...305..525S. doi:10.1126/science.1098918. PMID 15273396.
  16. Sebat, J; Lakshmi, B; Malhotra, D; et al. (April 2007). "Strong association of de novo copy number mutations with autism". Science. 316 (5823): 445–9. Bibcode:2007Sci...316..445S. doi:10.1126/science.1138659. PMC 2993504. PMID 17363630.
  17. Hodges, E; Xuan, Z; Balija, V; Kramer, M; Molla, MN; Smith, SW; Middle, CM; Rodesch, MJ; Albert, TJ (2007). "Genome-wide in situ exon capture for selective resequencing". Nat Genet. 39 (12): 1522–7. doi:10.1038/ng.2007.42. PMID 17982454.
  18. Navin, N; Kendall, J; Troge, J; et al. (April 2011). "Tumour evolution inferred by single-cell sequencing". Nature. 472 (7341): 90–4. Bibcode:2011Natur.472...90N. doi:10.1038/nature09807. PMC 4504184. PMID 21399628.
  19. Zuber, J; Shi, J; Wang, E; et al. (October 2011). "RNAi screen identifies Brd4 as a therapeutic target in acute myeloid leukaemia". Nature. 478 (7370): 524–8. Bibcode:2011Natur.478..524Z. doi:10.1038/nature10334. PMC 3328300. PMID 21814200.
  20. "ISIS initiates Phase 3 clinical trials for potential SMA therapy ISIS-SMNrx". The SMA Trust. Archived from the original on 2015-02-22. Retrieved 2015-02-22.
  21. Paul, Anirban; Crow, Megan; Raudales, Ricardo; He, Miao; Gillis, Jesse; Huang, Z. Josh (2017-10-19). "Transcriptional Architecture of Synaptic Communication Delineates GABAergic Neuron Identity". Cell (به English). 171 (3): 522–539.e20. doi:10.1016/j.cell.2017.08.032. ISSN 0092-8674. PMC 5772785. PMID 28942923.
  22. Chen, C; Li, B; Millman, S; et al. (January 2020). "Vitamin B6 Addiction in Acute Myeloid Leukemia". Cancer Cell. 37 (1): 71–84. doi:10.1016/j.ccell.2019.12.002. PMC 7197326 Check |pmc= value (help). PMID 31935373.
  23. "The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2009".
  24. [۱] See the classic paper McClintock B 1951 "Chromosome Organization and Genic Expression" (Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol 16: 13-47).
  25. A.D. Hershey and Martha Chase, "Independent Functions of Viral Protein and Nucleic Acid in Growth of Bacteriophage," J. General Physiology (September 20, 1952) 36:1, 39-56.
  26. "The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1969".
  27. "The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962".
  28. "The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1993".