دیرین‌پلی‌پلوئیدی

از ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد
مروری بر فرایند دیرین‌پلی‌پلوئیدی بسیاری از یوکاریوت‌های بالاتر در مقطعی از تاریخ تکامل خود پالئوپلی پلوئید بودند.

دیرین‌پلی‌پلوئیدی (به انگلیسی: Paleopolyploidy) نتیجه تکرارهای ژنومی است که حداقل چندین میلیون سال پیش رخ داده‌است (MYA). چنین رویدادی می‌تواند ژنوم یک گونه را دو برابر کند (خودپلی‌پلوئیدی) یا ژنوم دو گونه را ترکیب کند (دگرپلی‌پلوئیدی). به دلیل افزونگی عملکردی، ژن‌ها به سرعت خاموش می‌شوند یا از ژنوم‌های تکراری گم می‌شوند. بیشتر دیرین‌پلی‌پلوئیدها، در طول زمان تکامل، وضعیت پلی‌پلوئید خود را از طریق فرآیندی به نام دیپلوئیدسازی از دست داده‌اند، و اکنون دیپلوئیدهایی مانند مخمر نانوایی،[۱] Arabidopsis thaliana ,[۲] و شاید انسان در نظر گرفته می‌شوند.[۳][۴][۵][۶]

نموداری که تمام رویدادهای شناخته شده دیرین‌پلی‌پلوئیدسازی را خلاصه می‌کند.

اصطلاح mesopolyploid گاهی برای گونه‌هایی استفاده می‌شود که در تاریخ جدیدتر، مانند ۱۷ میلیون سال گذشته، تحت رویدادهای تکثیر کل ژنوم (تکثیر کل ژنوم، سه‌گانه‌سازی کل ژنوم و غیره) قرار گرفته‌اند.[۷]

یک رویداد پلی‌پلوئیدی ۱۶۰ million years ago فرض بر این است که خط اجدادی را ایجاد کرده‌اند که به همهٔ گیاهان گلدار مدرن منتهی شده‌است.[۸] این رویداد دیرین‌پلی‌پلوئیدی با تعیین توالی ژنوم یک گیاه گلدار باستانی، Amborella trichopoda مورد مطالعه قرار گرفت.[۹]

تشخیص دیرین‌پلی‌پلوئیدی با استفاده از Ks.

منابع[ویرایش]

  1. ↑ Kellis M, Birren BW, Lander ES (April 2004). "Proof and evolutionary analysis of ancient genome duplication in the yeast Saccharomyces cerevisiae". Nature. 428 (6983): 617–24. Bibcode:2004Natur.428..617K. doi:10.1038/nature02424. PMID 15004568.
  2. ↑ Bowers JE, Chapman BA, Rong J, Paterson AH (March 2003). "Unravelling angiosperm genome evolution by phylogenetic analysis of chromosomal duplication events". Nature. 422 (6930): 433–8. Bibcode:2003Natur.422..433B. doi:10.1038/nature01521. PMID 12660784.
  3. ↑ Smith JJ, Kuraku S, Holt C, Sauka-Spengler T, Jiang N, Campbell MS, Yandell MD, Manousaki T, Meyer A, Bloom OE, Morgan JR, Buxbaum JD, Sachidanandam R, Sims C, Garruss AS, Cook M, Krumlauf R, Wiedemann LM, Sower SA, Decatur WA, Hall JA, Amemiya CT, Saha NR, Buckley KM, Rast JP, Das S, Hirano M, McCurley N, Guo P, Rohner N, Tabin CJ, Piccinelli P, Elgar G, Ruffier M, Aken BL, Searle SM, Muffato M, Pignatelli M, Herrero J, Jones M, Brown CT, Chung-Davidson YW, Nanlohy KG, Libants SV, Yeh CY, McCauley DW, Langeland JA, Pancer Z, Fritzsch B, de Jong PJ, Zhu B, Fulton LL, Theising B, Flicek P, Bronner ME, Warren WC, Clifton SW, Wilson RK, Li W (April 2013). "Sequencing of the sea lamprey (Petromyzon marinus) genome provides insights into vertebrate evolution". Nature Genetics. 45 (4): 415–21, 421e1-2. doi:10.1038/ng.2568. PMC 3709584. PMID 23435085. {{cite journal}}: Unknown parameter |displayauthors= ignored (|display-authors= suggested) (help)
  4. ↑ Wolfe KH (May 2001). "Yesterday's polyploids and the mystery of diploidization". Nature Reviews. Genetics. 2 (5): 333–41. doi:10.1038/35072009. PMID 11331899.
  5. ↑ Blanc G, Wolfe KH (July 2004). "Widespread paleopolyploidy in model plant species inferred from age distributions of duplicate genes". The Plant Cell. 16 (7): 1667–78. doi:10.1105/tpc.021345. PMC 514152. PMID 15208399.
  6. ↑ Blanc G, Wolfe KH (July 2004). "Functional divergence of duplicated genes formed by polyploidy during Arabidopsis evolution". The Plant Cell. 16 (7): 1679–91. doi:10.1105/tpc.021410. PMC 514153. PMID 15208398.
  7. ↑ Wang X, Wang H, Wang J, Sun R, Wu J, Liu S, Bai Y, Mun JH, Bancroft I, Cheng F, Huang S, Li X, Hua W, Wang J, Wang X, Freeling M, Pires JC, Paterson AH, Chalhoub B, Wang B, Hayward A, Sharpe AG, Park BS, Weisshaar B, Liu B, Li B, Liu B, Tong C, Song C, Duran C, Peng C, Geng C, Koh C, Lin C, Edwards D, Mu D, Shen D, Soumpourou E, Li F, Fraser F, Conant G, Lassalle G, King GJ, Bonnema G, Tang H, Wang H, Belcram H, Zhou H, Hirakawa H, Abe H, Guo H, Wang H, Jin H, Parkin IA, Batley J, Kim JS, Just J, Li J, Xu J, Deng J, Kim JA, Li J, Yu J, Meng J, Wang J, Min J, Poulain J, Wang J, Hatakeyama K, Wu K, Wang L, Fang L, Trick M, Links MG, Zhao M, Jin M, Ramchiary N, Drou N, Berkman PJ, Cai Q, Huang Q, Li R, Tabata S, Cheng S, Zhang S, Zhang S, Huang S, Sato S, Sun S, Kwon SJ, Choi SR, Lee TH, Fan W, Zhao X, Tan X, Xu X, Wang Y, Qiu Y, Yin Y, Li Y, Du Y, Liao Y, Lim Y, Narusaka Y, Wang Y, Wang Z, Li Z, Wang Z, Xiong Z, Zhang Z (August 2011). "The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa". Nature Genetics. 43 (10): 1035–9. doi:10.1038/ng.919. PMID 21873998. {{cite journal}}: Unknown parameter |displayauthors= ignored (|display-authors= suggested) (help)
  8. ↑ Callaway E (December 2013). "Shrub genome reveals secrets of flower power". Nature. doi:10.1038/nature.2013.14426.
  9. ↑ Adams K (December 2013). "Genomics. Genomic clues to the ancestral flowering plant". Science. 342 (6165): 1456–7. Bibcode:2013Sci...342.1456A. doi:10.1126/science.1248709. PMID 24357306.


The image above contains clickable links
The image above contains clickable links
یک ژن ناحیه ای از DNA است که عملکرد را مشخص می‌کند. یک کروموزوم شامل یک رشته طولانی از DNA بوده که حاوی ژن‌های زیادی است. یک کروموزوم انسانی می‌تواند تا ۵۰۰ میلیون جفت باز DNA با هزاران ژن داشته باشد.
برگرفته از «https://fa.wikipedia.org/w/index.php?title=دیرین‌پلی‌پلوئیدی&oldid=36643266»