HDAC8

HDAC8
ساختارهای موجود
PDB	جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
فهرست شناسه‌های PDB
	1T64, 1T67, 1T69, 1VKG, 1W22, 2V5W, 2V5X, 3EW8, 3EWF, 3EZP, 3EZT, 3F06, 3F07, 3F0R, 3MZ3, 3MZ4, 3MZ6, 3MZ7, 3RQD, 3SFF, 3SFH, 4QA0, 4QA1, 4QA2, 4QA3, 4QA4, 4QA5, 4QA6, 4QA7, 4RN0, 4RN1, 4RN2, 5DC7, 5D1D, 5D1C, 5DC8, 5D1B, 5DC5, 5DC6, 5BWZ
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	HDAC8, CDLS5, HD8, HDACL1, MRXS6, RPD3, WTS, CDA07, histone deacetylase 8, KDAC8
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 300269 MGI: 1917565 HomoloGene: 41274 GeneCards: HDAC8
موقعیت ژن (انسان)
کروموزوم	کروموزوم X (انسان)
پایان	72,573,101 bp
موقعیت ژن (موش)
کروموزوم	کروموزوم X (موش)
پایان	101,548,965 bp
هستی‌شناسی ژن
عملکرد ملکولی	• Hsp90 protein binding; • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • histone deacetylase activity; • metal ion binding; • Hsp70 protein binding; • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی; • hydrolase activity; • chromatin binding; • transcription factor binding; • deacetylase activity;
ترکیبات سلولی	• سیتوپلاسم; • histone deacetylase complex; • سیتوزول; • پوسته یاخته; • نوکلئوپلاسم; • nuclear chromosome; • هسته یاخته;
فرایند زیستی	• histone H3 deacetylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of protein stability; • regulation of telomere maintenance; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • sister chromatid cohesion; • regulation of cohesin loading; • negative regulation of protein ubiquitination; • histone deacetylation; • negative regulation of gene expression; • cellular response to trichostatin A; • negative regulation of osteoblast differentiation; • cellular response to forskolin; • negative regulation of histone H3-K9 acetylation; • GO:0031497، GO:0006336، GO:0034724، GO:0001301، GO:0007580، GO:0034652، GO:0010847 chromatin organization; • GO:0003257، GO:0010735، GO:1901228، GO:1900622، GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H4 deacetylation;
	منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
	55869
	70315
	ENSG00000147099
	ENSMUSG00000067567
	Q9BY41
	Q8VH37
	NM_001166418، NM_001166419، NM_001166420، NM_001166422، NM_001166448، NM_018486، NR_051952، XM_011530986، XM_017029640، XM_017029641، XM_017029642، XM_017029643، XM_017029644، XM_017029645، XM_017029647، XM_047442252، XM_047442253، XM_047442255، XM_047442256، XM_047442257 XR_938402، NM_001166418، NM_001166419، NM_001166420، NM_001166422، NM_001166448، NM_018486، NR_051952، XM_011530986، XM_017029640، XM_017029641، XM_017029642، XM_017029643، XM_017029644، XM_017029645، XM_017029647، XM_047442252، XM_047442253، XM_047442255، XM_047442256، XM_047442257
	XM_006528275، XM_006528276، XM_011247671، XM_011247673، NM_001313742، XR_004940364 NM_027382، XM_006528275، XM_006528276، XM_011247671، XM_011247673، NM_001313742، XR_004940364
	NP_001159891، NP_001159892، NP_001159894، NP_001159920، NP_060956، XP_011529288، XP_016885129، XP_016885130، XP_016885131، XP_016885132، XP_016885133، XP_016885134، XP_016885135، XP_016885136، XP_024308173 NP_001159890، NP_001159891، NP_001159892، NP_001159894، NP_001159920، NP_060956، XP_011529288، XP_016885129، XP_016885130، XP_016885131، XP_016885132، XP_016885133، XP_016885134، XP_016885135، XP_016885136، XP_024308173
	NP_081658، XP_006528338، XP_006528339، XP_011245973، XP_011245975 NP_001300671، NP_081658، XP_006528338، XP_006528339، XP_011245973، XP_011245975
	ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان	مشاهده/ویرایش موش

هیستون دِاَستیلاز ۸ (انگلیسی: Histone deacetylase 8) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «HDAC8» کُدگذاری می‌شود.^[۵]^[۶]^[۷]

این پروتئین نقش بسیار مهمی در تنظیم رونویسی ژن‌ها، پیشرفتِ چرخهٔ سلولی و وقایع تکاملی سلول دارد.

اهمیت بالینی[ویرایش]

هیستون دِاَستیلاز ۸ با برخی بیماری‌ها از جمله لوسمی حاد مغز استخوان و همچنین در اسکلت سلولی اکتین در ماهیچه‌های صاف مرتبط است. آران‌اِی‌های خاموشگری که هیستون دِاَستیلاز ۸ را هدف قرار می‌دهند، خواص ضد سرطانی دارند.^[۸] مهار این آنزیم همچنین موجب القای آپوپتوز در «لنفوم‌های سلول تی» می‌گردد.^[۹]

هیستون دِاَستیلاز ۸ در بیماری‌زایی نوروبلاستوما هم نقش دارد.^[۱۰] در نتیجه پژوهشگران علاقه‌مندند تا مهارکننده‌های انتخابی این آنزیم را بسازند.^[۱۱]^[۱۲]

منابع[ویرایش]

↑ ^۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000147099 - Ensembl, May 2017
↑ ^۲٫۰ ^۲٫۱ ^۲٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000067567 - Ensembl, May 2017
↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ McDonell N, Ramser J, Francis F, Vinet MC, Rider S, Sudbrak R, Riesselman L, Yaspo ML, Reinhardt R, Monaco AP, Ross F, Kahn A, Kearney L, Buckle V, Chelly J (May 2000). "Characterization of a highly complex region in Xq13 and mapping of three isodicentric breakpoints associated with preleukemia". Genomics. 64 (3): 221–9. doi:10.1006/geno.2000.6128. PMID 10756090.
↑ Van den Wyngaert I, de Vries W, Kremer A, Neefs J, Verhasselt P, Luyten WH, Kass SU (Aug 2000). "Cloning and characterization of human histone deacetylase 8". FEBS Lett. 478 (1–2): 77–83. doi:10.1016/S0014-5793(00)01813-5. PMID 10922473.
↑ "Entrez Gene: HDAC8 histone deacetylase 8".
↑ Gallinari P, Di Marco S, Jones P, Pallaoro M, Steinkühler C (March 2007). "HDACs, histone deacetylation and gene transcription: from molecular biology to cancer therapeutics". Cell Res. 17 (3): 195–211. doi:10.1038/sj.cr.7310149. PMID 17325692.
↑ Balasubramanian S, Ramos J, Luo W, Sirisawad M, Verner E, Buggy JJ (May 2008). "A novel histone deacetylase 8 (HDAC8)-specific inhibitor PCI-34051 induces apoptosis in T-cell lymphomas". Leukemia. 22 (5): 1026–34. doi:10.1038/leu.2008.9. PMID 18256683.
↑ Oehme I, Deubzer HE, Wegener D, Pickert D, Linke JP, Hero B, Kopp-Schneider A, Westermann F, Ulrich SM, von Deimling A, Fischer M, Witt O (January 2009). "Histone deacetylase 8 in neuroblastoma tumorigenesis". Clin. Cancer Res. 15 (1): 91–9. doi:10.1158/1078-0432.CCR-08-0684. PMID 19118036.
↑ Patil V, Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M, Oyelere AK (May 2013). "3-Hydroxypyridin-2-thione as novel zinc binding group for selective histone deacetylase inhibition". Journal of Medicinal Chemistry. 56 (9): 3492–506. doi:10.1021/jm301769u. PMC 3657749. PMID 23547652.
↑ Suzuki T, Ota Y, Ri M, Bando M, Gotoh A, Itoh Y, Tsumoto H, Tatum PR, Mizukami T, Nakagawa H, Iida S, Ueda R, Shirahige K, Miyata N (November 2012). "Rapid discovery of highly potent and selective inhibitors of histone deacetylase 8 using click chemistry to generate candidate libraries". Journal of Medicinal Chemistry. 55 (22): 9562–75. doi:10.1021/jm300837y. PMID 23116147.

مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «HDAC8». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۱۰ مارس ۲۰۲۰.

Waltregny D, De Leval L, Glénisson W, Ly Tran S, North BJ, Bellahcène A, Weidle U, Verdin E, Castronovo V (2004). "Expression of histone deacetylase 8, a class I histone deacetylase, is restricted to cells showing smooth muscle differentiation in normal human tissues". Am J Pathol. 165 (2): 553–64. doi:10.1016/S0002-9440(10)63320-2. PMC 1618574. PMID 15277229.
Glénisson W, Waltregny D, Tran SL, North BJ, Verdin E, Colige A, Castronovo V (June 2005). "Histone deacetylase HDAC8 associates with smooth muscle alpha-actin and is essential for smooth muscle cell contractility". FASEB J. 19 (8): 966–8. doi:10.1096/fj.04-2303fje. PMID 15772115.
Wedel T, Van Eys GJ, Waltregny D, Glénisson W, Castronovo V, Vanderwinden JM (2006). "Novel smooth muscle markers reveal abnormalities of the intestinal musculature in severe colorectal motility disorders". Neurogastroenterol. Motil. 18 (7): 526–38. doi:10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x. PMID 16771768.
Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). "Class II histone deacetylases: versatile regulators". Trends Genet. 19 (5): 286–93. CiteSeerX 10.1.1.464.415. doi:10.1016/S0168-9525(03)00073-8. PMID 12711221.
Hu E, Chen Z, Fredrickson T, et al. (2000). "Cloning and characterization of a novel human class I histone deacetylase that functions as a transcription repressor". J. Biol. Chem. 275 (20): 15254–64. doi:10.1074/jbc.M908988199. PMID 10748112.
Buggy JJ, Sideris ML, Mak P, et al. (2001). "Cloning and characterization of a novel human histone deacetylase, HDAC8". Biochem. J. 350 (1): 199–205. doi:10.1042/0264-6021:3500199. PMC 1221242. PMID 10926844.
Amann JM, Nip J, Strom DK, et al. (2001). "ETO, a target of t(8;21) in acute leukemia, makes distinct contacts with multiple histone deacetylases and binds mSin3A through its oligomerization domain". Mol. Cell. Biol. 21 (19): 6470–83. doi:10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001. PMC 99794. PMID 11533236.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Durst KL, Lutterbach B, Kummalue T, et al. (2003). "The inv(16) fusion protein associates with corepressors via a smooth muscle myosin heavy-chain domain". Mol. Cell. Biol. 23 (2): 607–19. doi:10.1128/MCB.23.2.607-619.2003. PMC 151524. PMID 12509458.
Rodriguez M, Yu X, Chen J, Songyang Z (2004). "Phosphopeptide binding specificities of BRCA1 COOH-terminal (BRCT) domains". J. Biol. Chem. 278 (52): 52914–8. doi:10.1074/jbc.C300407200. PMID 14578343.
Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P, et al. (2004). "Genome-wide survey of human alternative pre-mRNA splicing with exon junction microarrays". Science. 302 (5653): 2141–4. CiteSeerX 10.1.1.1017.9438. doi:10.1126/science.1090100. PMID 14684825.
Lee H, Rezai-Zadeh N, Seto E (2004). "Negative regulation of histone deacetylase 8 activity by cyclic AMP-dependent protein kinase A". Mol. Cell. Biol. 24 (2): 765–73. doi:10.1128/MCB.24.2.765-773.2004. PMC 343812. PMID 14701748.
Vannini A, Volpari C, Filocamo G, et al. (2004). "Crystal structure of a eukaryotic zinc-dependent histone deacetylase, human HDAC8, complexed with a hydroxamic acid inhibitor". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (42): 15064–9. doi:10.1073/pnas.0404603101. PMC 524051. PMID 15477595.
Waltregny D, North B, Van Mellaert F, et al. (2005). "Screening of histone deacetylases (HDAC) expression in human prostate cancer reveals distinct class I HDAC profiles between epithelial and stromal cells". European Journal of Histochemistry. 48 (3): 273–90. PMID 15590418.
Waltregny D, Glénisson W, Tran SL, et al. (2006). "Histone deacetylase HDAC8 associates with smooth muscle alpha-actin and is essential for smooth muscle cell contractility". FASEB J. 19 (8): 966–8. doi:10.1096/fj.04-2303fje. PMID 15772115.
Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA (2006). "Catalytic activity and inhibition of human histone deacetylase 8 is dependent on the identity of the active site metal ion". Biochemistry. 45 (19): 6170–8. doi:10.1021/bi060212u. PMID 16681389.
Lee H, Sengupta N, Villagra A, et al. (2006). "Histone deacetylase 8 safeguards the human ever-shorter telomeres 1B (hEST1B) protein from ubiquitin-mediated degradation". Mol. Cell. Biol. 26 (14): 5259–69. doi:10.1128/MCB.01971-05. PMC 1592721. PMID 16809764.
Vannini A, Volpari C, Gallinari P, et al. (2007). "Substrate binding to histone deacetylases as shown by the crystal structure of the HDAC8-substrate complex". EMBO Reports. 8 (9): 879–84. doi:10.1038/sj.embor.7401047. PMC 1973954. PMID 17721440.
Nakagawa M, Oda Y, Eguchi T, et al. (2007). "Expression profile of class I histone deacetylases in human cancer tissues". Oncol. Rep. 18 (4): 769–74. doi:10.3892/or.18.4.769. PMID 17786334.

پیوند به بیرون[ویرایش]

HDAC8 protein, human در سرعنوان‌های موضوعی پزشکی (MeSH) در کتابخانهٔ ملی پزشکی ایالات متحدهٔ آمریکا

[refGRCh38Ensembl-1] ۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000147099 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ۲٫۰ ^۲٫۱ ^۲٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000067567 - Ensembl, May 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid_10756090-5] McDonell N, Ramser J, Francis F, Vinet MC, Rider S, Sudbrak R, Riesselman L, Yaspo ML, Reinhardt R, Monaco AP, Ross F, Kahn A, Kearney L, Buckle V, Chelly J (May 2000). "Characterization of a highly complex region in Xq13 and mapping of three isodicentric breakpoints associated with preleukemia". Genomics. 64 (3): 221–9. doi:10.1006/geno.2000.6128. PMID 10756090.

[pmid_10922473-6] Van den Wyngaert I, de Vries W, Kremer A, Neefs J, Verhasselt P, Luyten WH, Kass SU (Aug 2000). "Cloning and characterization of human histone deacetylase 8". FEBS Lett. 478 (1–2): 77–83. doi:10.1016/S0014-5793(00)01813-5. PMID 10922473.

[entrez-7] "Entrez Gene: HDAC8 histone deacetylase 8".

[pmid_17325692-8] Gallinari P, Di Marco S, Jones P, Pallaoro M, Steinkühler C (March 2007). "HDACs, histone deacetylation and gene transcription: from molecular biology to cancer therapeutics". Cell Res. 17 (3): 195–211. doi:10.1038/sj.cr.7310149. PMID 17325692.

[pmid_18256683-9] Balasubramanian S, Ramos J, Luo W, Sirisawad M, Verner E, Buggy JJ (May 2008). "A novel histone deacetylase 8 (HDAC8)-specific inhibitor PCI-34051 induces apoptosis in T-cell lymphomas". Leukemia. 22 (5): 1026–34. doi:10.1038/leu.2008.9. PMID 18256683.

[pmid_19118036-10] Oehme I, Deubzer HE, Wegener D, Pickert D, Linke JP, Hero B, Kopp-Schneider A, Westermann F, Ulrich SM, von Deimling A, Fischer M, Witt O (January 2009). "Histone deacetylase 8 in neuroblastoma tumorigenesis". Clin. Cancer Res. 15 (1): 91–9. doi:10.1158/1078-0432.CCR-08-0684. PMID 19118036.

[pmid_23547652-11] Patil V, Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M, Oyelere AK (May 2013). "3-Hydroxypyridin-2-thione as novel zinc binding group for selective histone deacetylase inhibition". Journal of Medicinal Chemistry. 56 (9): 3492–506. doi:10.1021/jm301769u. PMC 3657749. PMID 23547652.

[pmid_23116147-12] Suzuki T, Ota Y, Ri M, Bando M, Gotoh A, Itoh Y, Tsumoto H, Tatum PR, Mizukami T, Nakagawa H, Iida S, Ueda R, Shirahige K, Miyata N (November 2012). "Rapid discovery of highly potent and selective inhibitors of histone deacetylase 8 using click chemistry to generate candidate libraries". Journal of Medicinal Chemistry. 55 (22): 9562–75. doi:10.1021/jm300837y. PMID 23116147.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]

[۹]

[۱۰]

[۱۱]

[۱۲]

ن ب و آنزیم‌ها
فعالیت	جایگاه فعال جایگاه اتصال سه‌گانه کاتالیزگر Oxyanion hole Enzyme promiscuity Catalytically perfect enzyme کوآنزیم کوفاکتور کاتالیز آنزیم
قواعد	دگرریختاری Cooperativity بازدارنده آنزیم فعال‌کننده آنزیم
دسته‌بندی	عدد گروه آنزیم ابرخانواده آنزیم خانواده آنزیم فهرست آنزیم‌ها
سینتیک	سینتیک میکائلیس–منتن طرح ادی هوفستی طرح لاینویور برک طرح هانس وولف
انواع	ای‌سی۱ اکسیدوردوکتازها (فهرست) ای‌سی۲ ترانسفرازها (فهرست) ای‌سی۳ هیدرولازها (فهرست) ای‌سی۴ لیازها (فهرست) ای‌سی۵ ایزومرازها (فهرست) ای‌سی۶ لیگازها (فهرست) ای‌سی۷ ترنسلوکازها (فهرست)