قالب فستک
 |
این مقاله نیازمند تمیزکاری است. لطفاً تا جای امکان آنرا از نظر املا، انشا، چیدمان و درستی بهتر کنید، سپس این الگو را از بالای مقاله بردارید. محتویات این مقاله ممکن است غیر قابل اعتماد و نادرست یا جانبدارانه باشد یا قوانین حقوق پدیدآورندگان را نقض کرده باشد. |
 |
این نوشتار یا بخش، مفهوم کامل و روشن را نمیرساند. لطفاً با ویرایش کردن یا افزودن جزئیات بیشتر به بهبود مقاله کمک کنید و سپس این برچسب را بردارید. |
 |
ممکن است این مقاله نیازمند ویکیسازی باشد تا با استانداردهای کیفی ویکیپدیا همخوانی یابد. خواهشمندیم با افزودن پیوندهای داخلی مرتبط، یا با بهبود چیدمان به بهبود آن کمک کنید. (ژوئن ۲۰۱۲)
برای جزئیات بیشتر روی [نمایش] کلیک کنید.
هیچ دلیلی برای این برچسب ویکیسازی ذکر نشدهاست. میتوانید دلیلتان را با استفاده از پارامتر
|
قالب فستک (FASTQ) قالب مبتنی بر متن برای ذخیرهسازی هر دوی رشتههای زیستی (معمولاً توالی اسید نوکلئیک) و نمره کیفیت متناظر آن است. هر دوی رشته و نمره کیفیت، با یک کاراکتر ASCII تنها برای اختصار کدگذاری شدهاست. نخست موسسه ولکام تراست سانگ (Wellcome Trust Sanger Institute) برای بسته بندی یک دنباله قالب فستا و دادههای کیفیت آن تولید کرد، اما به تازگی در حال تبدیل شدن به استاندارد برای ذخیره سازی خروجی دستگاههای با توان بالا مانند دستگاه آنالیز ژنوم Illumina میباشد.
قالب [ویرایش]
فایل فستک به طور معمول از چهار خط در هر دنباله استفاده میکند. خط اول با یک نویسه '@' شروع میشود و توسط دنباله شناسه و شرح اختیاری (مثل خط عنوان فستا) ادامه مییابد. خط دوم رشتهٔ خام است. خط سوم با نویسه '+' آغاز میشود و دوباره توسط همان شناسهٔ رشته (و همان توضیحات)به صورت اختیاری دنبال میشود. خط چهارم کد شدهٔ مقادیر کیفیت برای دنبالهای درج شده در خط دوم، میباشد و باید به همان تعداد از نمادها را شامل باشد. یک نمونه از آن به صورت زیر میباشد:
@SEQ_ID GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT + !''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
جستارهای وابسته [ویرایش]
پیوست [ویرایش]
- MAQ صفحهای برای بحث روی انواع فستک
