ترموس
ترموس | |
---|---|
ترموس آکواتیکوس | |
ردهبندی علمی | |
حوزه: | باکتریها |
شاخه: | Deinococcota |
رده: | Deinococci |
راسته: | ترمالها |
تیره: | ترمالها |
سرده: | ترموس براک و فریز ۱۹۶۹ |
ترموس سردهای از باکتریهای گرمادوست و یکی از چندین سردهٔ باکتریایی متعلق به شاخهٔ داینوکوکوتا است. گونههای ترموس را میتوان از سایر سردههای خانوادهٔ ترمالها و همچنین تمام باکتریهای دیگر با حضور هشت ایندل حفاظتشده (CSIs)، موجود در پروتئینهایی مانند آدنیلات کیناز و دیانای هلیکاز همانندسازیکننده و همچنین ۱۴ پروتئین حفاظتشده (CSPs)، متمایز کرد که بهطور انحصاری، در اعضای این سرده مشترک هستند.[۱]
گونهها
[ویرایش]سردهٔ ترموس، شامل گونههای زیر است:[۲][۳][۴]
- " T. Caldophilus " * تاگوچی و همکاران. ۱۹۸۳
- " T. eggertssonii " * پیترز ۲۰۰۸
- " T. kawarayensis " * کوروساوا و همکاران. ۲۰۰۵
- " T. murrieta " * بنر و همکاران. ۲۰۰۶
- " T. nonproteolyticus " * ۱۹۹۲
- " T. parvatiensis " * دویدی و همکاران. ۲۰۱۵
- " T. rehai " * لین و همکاران. ۲۰۰۲
- " T. yunnanensis " * گونگ و همکاران. ۲۰۰۵
- Thermus amyloliquefaciens یو و همکاران. ۲۰۱۵[۵]
- Thermus antranikianii ۲۰۰۰[۶]
- ترموس آکواتیکوس براک و فریز، ۱۹۶۹[۷]
- Thermus arciformis ژانگ و همکاران. ۲۰۱۰[۸]
- Thermus brockianus ویلیامز ۱۹۹۹[۹]
- Thermus caldifontis خان و همکاران. ۲۰۱۷
- Thermus caliditerrae مینگ و همکاران. ۲۰۱۴[۱۰]
- Thermus chliarophilus تنریو و همکاران. ۱۹۹۵[۱۱]
- Thermus composti واینا و همکاران. ۲۰۱۲[۱۲]
- Thermus filiformis هادسون ۱۹۸۷[۱۳]
- Thermus igniterrae ۲۰۰۰[۶]
- Thermus islandicus ۲۰۰۹[۱۴]
- Thermus oshimai ویلیامز و همکاران. ۱۹۹۶[۱۵]
- Thermus scotoductus ۱۹۹۴[۱۶]
- Thermus tengchongensis یو، یائو، مینگ، یین، ژو، لیو، تانگ و لی، ۲۰۱۳[۱۷]
- ترموس ترموفیلوس ۱۹۷۴، سپس ۱۹۹۵[۱۸]
فیلوژنی
[ویرایش]طبقهبندی پذیرفته شده در حال حاضر بر اساس فهرست نامهای پروکاریوتی (LPSN) و بررسی آرانای ریبوزومی ۱۶اِس[۱۹] و مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI)[۲۰] بهصورت زیر است.[۲۱]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
نکته: سویههایی که در مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری (NCBI) یافت شدهاند، اما در فهرست نامهای پروکاریوتی با نامگذاری (LPSN) فهرست نشدهاند با علامت * مشخص شدهاند.
جستارهای وابسته
[ویرایش]منابع
[ویرایش]- ↑ Ho, Jonathan; Adeolu, Mobolaji; Khadka, Bijendra; Gupta, Radhey S. (October 2016). "Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus–Thermus" and distinguish its main constituent groups". Systematic and Applied Microbiology. 39 (7): 453–463. doi:10.1016/j.syapm.2016.07.003. ISSN 0723-2020.
- ↑ Brock TD; Freeze H (1969). "Thermus aquaticus, a Nonsporulating Extreme Thermophile". J. Bacteriol. 98 (1): 289–97. doi:10.1128/jb.98.1.289-297.1969. PMC 249935. PMID 5781580.
- ↑ Chung, A. P.; Rainey, F. A.; Valente, M.; Nobre, M. F.; da Costa, M. S. (2000). "Thermus igniterrae sp. nov. and Thermus antranikianii sp. nov. , two new species from Iceland". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (1): 209–217. doi:10.1099/00207713-50-1-209. ISSN 1466-5026. PMID 10826806.
- ↑ LSPN. "Thermus". LPSN. Retrieved 2016-03-10.
- ↑ Yu, Tian-Tian; Park, Dong-Jin; Hozzein, Wael N.; Kim, Chang-Jin; Wadaan, Mohammed A. M.; Ming, Hong; Li, Wen-Jun; Yao, Ji-Cheng; Zhou, En-Min (2015-08-01). "Thermus amyloliquefaciens sp. nov. , isolated from a hot spring sediment sample". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 65 (8): 2491–2495. doi:10.1099/ijs.0.000289. PMID 25920724.
- ↑ ۶٫۰ ۶٫۱ Chung, A. P.; Rainey, F. A.; Valente, M.; Nobre, M. F.; Costa, M. S. da (2000-01-01). "Thermus igniterrae sp. nov. and Thermus antranikianii sp. nov. , two new species from Iceland". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (1): 209–217. doi:10.1099/00207713-50-1-209. PMID 10826806.
- ↑ Brock, Thomas D.; Freeze, Hudson (1969-04-01). "Thermus aquaticus gen. n. and sp. n. , a Nonsporulating Extreme Thermophile". Journal of Bacteriology (به انگلیسی). 98 (1): 289–297. doi:10.1128/jb.98.1.289-297.1969. ISSN 0021-9193. PMC 249935. PMID 5781580.
- ↑ Zhang, X. Q.; Ying, Y.; Ye, Y.; Xu, X. W.; Zhu, X. F.; Wu, M. (2010-04-01). "Thermus arciformis sp. nov. , a thermophilic species from a geothermal area". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 60 (4): 834–839. doi:10.1099/ijs.0.007690-0. PMID 19661520.
- ↑ WILLIAMS, R. A. D.; SMITH, K. E.; WELCH, S. G.; MICALLEF, J.; SHARP, R. J. (1995-07-01). "DNA Relatedness of Thermus Strains, Description of Thermus brockianus sp. nov. , and Proposal To Reestablish Thermus thermophilus (Oshima and Imahori)". International Journal of Systematic Bacteriology. 45 (3): 495–499. doi:10.1099/00207713-45-3-495. PMID 8590676.
- ↑ Ming, H.; Yin, Y. -R.; Li, S.; Nie, G. -X.; Yu, T. -T.; Zhou, E. -M.; Liu, L.; Dong, L.; Li, W. -J. (2014-02-01). "Thermus caliditerrae sp. nov. , a novel thermophilic species isolated from a geothermal area". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 64 (Pt 2): 650–656. doi:10.1099/ijs.0.056838-0. PMID 24158953.
- ↑ TENREIRO, S.; NOBRE, M. F.; COSTA, M. S. DA (1995-10-01). "Thermus silvanus sp. nov. and Thermus chliarophilus sp. nov. , Two New Species Related to Thermus ruber but with Lower Growth Temperatures". International Journal of Systematic Bacteriology. 45 (4): 633–639. doi:10.1099/00207713-45-4-633. PMID 7547281.
- ↑ Vajna, B.; Kanizsai, S.; Keki, Z.; Marialigeti, K.; Schumann, P.; Toth, E. M. (2012-07-01). "Thermus composti sp. nov. , isolated from oyster mushroom compost". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (Pt 7): 1486–1490. doi:10.1099/ijs.0.030866-0. PMID 21856987.
- ↑ Hudson, J. A.; Morgan, H. W.; Daniel, R. M. (1987-01-01). "Thermus filiformis sp. nov. , a Filamentous Caldoactive Bacterium". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 37 (4): 431–436. doi:10.1099/00207713-37-4-431.
- ↑ Bjornsdottir, Snaedis H.; Petursdottir, Solveig K.; Hreggvidsson, Gudmundur O.; Skirnisdottir, Sigurlaug; Hjorleifsdottir, Sigridur; Arnfinnsson, Johann; Kristjansson, Jakob K. (2009-01-01). "Thermus islandicus sp. nov. , a mixotrophic sulfur-oxidizing bacterium isolated from the Torfajokull geothermal area". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59 (12): 2962–2966. doi:10.1099/ijs.0.007013-0. PMID 19628590.
- ↑ WILLIAMS, RALPH A. D.; SMITH, KELVIN E.; WELCH, SIMON G.; MICALLEF, JANICE (1996-01-01). "Thermus oshimai sp. nov. , Isolated from Hot Springs in Portugal, Iceland, and the Azores, and Comment on the Concept of a Limited Geographical Distribution of Thermus Species". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 46 (2): 403–408. doi:10.1099/00207713-46-2-403. PMID 8934898.
- ↑ Kristjánsson, Jakob; Hjörleifsdóttir, Sigrídur; Marteinsson, Viggó; Alfredsson, Gudni (1994). "Thermus scotoductus, sp. nov. , a Pigment-Producing Thermophilic Bacterium from Hot Tap Water in Iceland and Including Thermus sp. X-1". Systematic and Applied Microbiology. 17 (1): 44–50. doi:10.1016/S0723-2020(11)80030-5.
- ↑ Yu, Tian-Tian; Yao, Ji-Cheng; Ming, Hong; Yin, Yi-Rui; Zhou, En-Min; Liu, Min-Jiao; Tang, Shu-Kun; Li, Wen-Jun (2013). "Thermus tengchongensis sp. nov. , isolated from a geothermally heated soil sample in Tengchong, Yunnan, south-west China". Antonie van Leeuwenhoek. 103 (3): 513–518. doi:10.1007/s10482-012-9833-9. PMID 23104072.
- ↑ Manaia, Célia M.; Hoste, Bart; Carmen Gutierrez, M.; Gillis, Monique; Ventosa, Antonio; Kersters, Karel; Da Costa, Milton S. (1995-02-01). "Halotolerant Thermus Strains from Marine and Terrestrial Hot Springs Belong to Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori, 1974) nom. rev. emend". Systematic and Applied Microbiology. 17 (4): 526–532. doi:10.1016/S0723-2020(11)80072-X.
- ↑ J.P. Euzéby. "Deinococcus–Thermus". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2018-07-20.
- ↑ Sayers; et al. "Deinococcus–Thermus". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2018-07-20.
- ↑ "16S rRNA-based LTP release 132 (full tree)". All-Species Living Tree Project. Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Retrieved 2018-07-20.