SWI/SNF

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

ای‌تی‌پاز اس‌ان‌اف۲ متصل به نوکلئوزوم
ای‌تی‌پاز اس‌ان‌اف۲ متصل به نوکلئوزوم
شناسه‌ها
نماد	Snf2
پی‌فم	PF00176
اینترپرو	IPR000330
SMART	DEXDc
SCOPe	5x0x / SUPFAM
پی‌فم
ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

در زیست‌شناسی مولکولی SWI/SNF (که مخفف SWItch/Sucrose Non-Fermentable یا سوئیچ/سوکروز غیرقابل تخمیر است)^[۱]^[۲] یکی از زیرگروه‌های خانوادهٔ «بازسازی‌کننده‌های کروماتین وابسته به آدنوزین تری‌فسفات» است که در یوکاریوت‌ها یافت می‌شود. به عبارت دیگر، این مجموعهٔ مولکولی، گروهی از پروتئین‌ها و چندین پُلی‌پپتید هستند که در بازسازی ساختار فضایی دی‌ان‌ای نقش دارند.^[۳] این مولکول‌ها سبب نوآرایی نوکلئوزوم شده و دسترسی آسان‌تر به کروماتین را فراهم می‌کند، و اتصال فاکتورهای رونویسی خاص را ممکن می‌سازد^[۴] و اجازه می‌دهد تا برخی ژن‌ها فعال یا سرکوب شوند.^[۵] این مجموعه پروتئینی مهم نخستین بار در سال ۱۹۹۸ در یک نوع تومور بدخیم کودکان کشف شد.^[۶]

مجموعهٔ SWI/SNF به عنوان یک سرکوب کننده تومور در بسیاری از سرطان‌های بدخیم انسان نقشی ایفا می‌کند.^[۷] عملکرد کمپلکس SWI/SNF در پستانداران بسیار وابسته به بافتی است که در آن حضور دارد،^[۸] و علاوه بر نقش آن به عنوان یک سرکوب کننده تومور که در بالا توضیح داده شد، کمپلکس‌های SWI/SNF همچنین در بروز چندین ضایعهٔ سرطانی مختلف از جمله لوسمی حاد میلوئیدی،^[۹]^[۱۰] سرطان پروستات،^[۱۱] نوروبلاستوما،^[۱۲] ملانوم یووه‌آ (نوعی سرطان چشم)،^[۱۳] و سارکوم پوشینه مفصلی^[۱۴] نقش دارد.

جستارهای وابسته

Mdm2

منابع

↑ Neigeborn L, Carlson M (December 1984). "Genes affecting the regulation of SUC2 gene expression by glucose repression in Saccharomyces cerevisiae". Genetics. 108 (4): 845–858. doi:10.1093/genetics/108.4.845. PMC 1224269. PMID 6392017.
↑ Stern M, Jensen R, Herskowitz I (October 1984). "Five SWI genes are required for expression of the HO gene in yeast". Journal of Molecular Biology. 178 (4): 853–868. doi:10.1016/0022-2836(84)90315-2. PMID 6436497.
↑ Pazin MJ, Kadonaga JT (March 1997). "SWI2/SNF2 and related proteins: ATP-driven motors that disrupt protein-DNA interactions?". Cell. 88 (6): 737–740. doi:10.1016/S0092-8674(00)81918-2. PMID 9118215.
↑ Barisic, Darko; Stadler, Michael B.; Iurlaro, Mario; Schübeler, Dirk (May 2019). "Mammalian ISWI and SWI/SNF selectively mediate binding of distinct transcription factors". Nature (به انگلیسی). 569 (7754): 136–140. Bibcode:2019Natur.569..136B. doi:10.1038/s41586-019-1115-5. ISSN 1476-4687. PMC 6522387. PMID 30996347.
↑ Clapier CR, Iwasa J, Cairns BR, Peterson CL (July 2017). "Mechanisms of action and regulation of ATP-dependent chromatin-remodelling complexes". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 18 (7): 407–422. doi:10.1038/nrm.2017.26. PMC 8127953. PMID 28512350.
↑ Versteege I, Sévenet N, Lange J, Rousseau-Merck MF, Ambros P, Handgretinger R, et al. (July 1998). "Truncating mutations of hSNF5/INI1 in aggressive paediatric cancer". Nature. 394 (6689): 203–206. Bibcode:1998Natur.394..203V. doi:10.1038/28212. PMID 9671307. S2CID 6019090.
↑ Hodges C, Kirkland JG, Crabtree GR (August 2016). "The Many Roles of BAF (mSWI/SNF) and PBAF Complexes in Cancer". Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. 6 (8): a026930. doi:10.1101/cshperspect.a026930. PMC 4968166. PMID 27413115.
↑ Alver, Burak H.; Kim, Kimberly H.; Lu, Ping; Wang, Xiaofeng; Manchester, Haley E.; Wang, Weishan; Haswell, Jeffrey R.; Park, Peter J.; Roberts, Charles W. M. (2017-03-06). "The SWI/SNF chromatin remodelling complex is required for maintenance of lineage specific enhancers". Nature Communications. 8: 14648. Bibcode:2017NatCo...814648A. doi:10.1038/ncomms14648. ISSN 2041-1723. PMC 5343482. PMID 28262751.
↑ Chambers, Courtney; Cermakova, Katerina; Chan, Yuen San; Kurtz, Kristen; Wohlan, Katharina; Lewis, Andrew Henry; Wang, Christiana; Pham, Anh; Dejmek, Milan; Sala, Michal; Loeza Cabrera, Mario; Aguilar, Rogelio; Nencka, Radim; Lacorazza, Daniel; Rau, Rachel E. (2023-01-20). "SWI/SNF blockade disrupts PU.1-directed enhancer programs in normal hematopoietic cells and acute myeloid leukemia". Cancer Research. 83 (7): CAN–22–2129. doi:10.1158/0008-5472.CAN-22-2129. ISSN 1538-7445. PMC 10071820. PMID 36662812. S2CID 256031128.
↑ Rago, Florencia; Rodrigues, Lindsey Ulkus; Bonney, Megan; Sprouffske, Kathleen; Kurth, Esther; Elliott, GiNell; Ambrose, Jessi; Aspesi, Peter; Oborski, Justin; Chen, Julie T.; McDonald, E. Robert; Mapa, Felipa A.; Ruddy, David A.; Kauffmann, Audrey; Abrams, Tinya (2022-03-01). "Exquisite Sensitivity to Dual BRG1/BRM ATPase Inhibitors Reveals Broad SWI/SNF Dependencies in Acute Myeloid Leukemia". Molecular Cancer Research. 20 (3): 361–372. doi:10.1158/1541-7786.MCR-21-0390. ISSN 1557-3125. PMID 34799403. S2CID 244454472.
↑ Xiao, Lanbo; Parolia, Abhijit; Qiao, Yuanyuan; Bawa, Pushpinder; Eyunni, Sanjana; Mannan, Rahul; Carson, Sandra E.; Chang, Yu; Wang, Xiaoju; Zhang, Yuping; Vo, Josh N.; Kregel, Steven; Simko, Stephanie A.; Delekta, Andrew D.; Jaber, Mustapha (January 2022). "Targeting SWI/SNF ATPases in enhancer-addicted prostate cancer". Nature. 601 (7893): 434–439. Bibcode:2022Natur.601..434X. doi:10.1038/s41586-021-04246-z. ISSN 1476-4687. PMC 8770127. PMID 34937944.
↑ Cermakova, Katerina; Tao, Ling; Dejmek, Milan; Sala, Michal; Montierth, Matthew D.; Chan, Yuen San; Patel, Ivanshi; Chambers, Courtney; Loeza Cabrera, Mario; Hoffman, Dane; Parchem, Ronald J.; Wang, Wenyi; Nencka, Radim; Barbieri, Eveline; Hodges, H. Courtney (2023-11-23). "Reactivation of the G1 enhancer landscape underlies core circuitry addiction to SWI/SNF". Nucleic Acids Research. 52 (1): 4–21. doi:10.1093/nar/gkad1081. ISSN 1362-4962. PMC 10783513. PMID 37993417.
↑ Rago, Florencia; Elliott, GiNell; Li, Ailing; Sprouffske, Kathleen; Kerr, Grainne; Desplat, Aurore; Abramowski, Dorothee; Chen, Julie T.; Farsidjani, Ali; Xiang, Kay X.; Bushold, Geoffrey; Feng, Yun; Shirley, Matthew D.; Bric, Anka; Vattay, Anthony (October 2020). "The Discovery of SWI/SNF Chromatin Remodeling Activity as a Novel and Targetable Dependency in Uveal Melanoma". Molecular Cancer Therapeutics. 19 (10): 2186–2195. doi:10.1158/1535-7163.MCT-19-1013. ISSN 1538-8514. PMID 32747420. S2CID 222093985.
↑ Brien, Gerard L.; Remillard, David; Shi, Junwei; Hemming, Matthew L.; Chabon, Jonathon; Wynne, Kieran; Dillon, Eugène T.; Cagney, Gerard; Van Mierlo, Guido; Baltissen, Marijke P.; Vermeulen, Michiel; Qi, Jun; Fröhling, Stefan; Gray, Nathanael S.; Bradner, James E. (2018-11-15). "Targeted degradation of BRD9 reverses oncogenic gene expression in synovial sarcoma". eLife. 7: e41305. doi:10.7554/eLife.41305. ISSN 2050-084X. PMC 6277197. PMID 30431433.

این یک مقالهٔ خرد زیست‌شناسی مولکولی است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید.

[pmid6392017-1] Neigeborn L, Carlson M (December 1984). "Genes affecting the regulation of SUC2 gene expression by glucose repression in Saccharomyces cerevisiae". Genetics. 108 (4): 845–858. doi:10.1093/genetics/108.4.845. PMC 1224269. PMID 6392017.

[pmid6436497-2] Stern M, Jensen R, Herskowitz I (October 1984). "Five SWI genes are required for expression of the HO gene in yeast". Journal of Molecular Biology. 178 (4): 853–868. doi:10.1016/0022-2836(84)90315-2. PMID 6436497.

[pmid9118215-3] Pazin MJ, Kadonaga JT (March 1997). "SWI2/SNF2 and related proteins: ATP-driven motors that disrupt protein-DNA interactions?". Cell. 88 (6): 737–740. doi:10.1016/S0092-8674(00)81918-2. PMID 9118215.

[4] Barisic, Darko; Stadler, Michael B.; Iurlaro, Mario; Schübeler, Dirk (May 2019). "Mammalian ISWI and SWI/SNF selectively mediate binding of distinct transcription factors". Nature (به انگلیسی). 569 (7754): 136–140. Bibcode:2019Natur.569..136B. doi:10.1038/s41586-019-1115-5. ISSN 1476-4687. PMC 6522387. PMID 30996347.

[Clapier_2017-5] Clapier CR, Iwasa J, Cairns BR, Peterson CL (July 2017). "Mechanisms of action and regulation of ATP-dependent chromatin-remodelling complexes". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 18 (7): 407–422. doi:10.1038/nrm.2017.26. PMC 8127953. PMID 28512350.

[pmid9671307-6] Versteege I, Sévenet N, Lange J, Rousseau-Merck MF, Ambros P, Handgretinger R, et al. (July 1998). "Truncating mutations of hSNF5/INI1 in aggressive paediatric cancer". Nature. 394 (6689): 203–206. Bibcode:1998Natur.394..203V. doi:10.1038/28212. PMID 9671307. S2CID 6019090.

[7] Hodges C, Kirkland JG, Crabtree GR (August 2016). "The Many Roles of BAF (mSWI/SNF) and PBAF Complexes in Cancer". Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. 6 (8): a026930. doi:10.1101/cshperspect.a026930. PMC 4968166. PMID 27413115.

[8] Alver, Burak H.; Kim, Kimberly H.; Lu, Ping; Wang, Xiaofeng; Manchester, Haley E.; Wang, Weishan; Haswell, Jeffrey R.; Park, Peter J.; Roberts, Charles W. M. (2017-03-06). "The SWI/SNF chromatin remodelling complex is required for maintenance of lineage specific enhancers". Nature Communications. 8: 14648. Bibcode:2017NatCo...814648A. doi:10.1038/ncomms14648. ISSN 2041-1723. PMC 5343482. PMID 28262751.

[:1-9] Chambers, Courtney; Cermakova, Katerina; Chan, Yuen San; Kurtz, Kristen; Wohlan, Katharina; Lewis, Andrew Henry; Wang, Christiana; Pham, Anh; Dejmek, Milan; Sala, Michal; Loeza Cabrera, Mario; Aguilar, Rogelio; Nencka, Radim; Lacorazza, Daniel; Rau, Rachel E. (2023-01-20). "SWI/SNF blockade disrupts PU.1-directed enhancer programs in normal hematopoietic cells and acute myeloid leukemia". Cancer Research. 83 (7): CAN–22–2129. doi:10.1158/0008-5472.CAN-22-2129. ISSN 1538-7445. PMC 10071820. PMID 36662812. S2CID 256031128.

[10] Rago, Florencia; Rodrigues, Lindsey Ulkus; Bonney, Megan; Sprouffske, Kathleen; Kurth, Esther; Elliott, GiNell; Ambrose, Jessi; Aspesi, Peter; Oborski, Justin; Chen, Julie T.; McDonald, E. Robert; Mapa, Felipa A.; Ruddy, David A.; Kauffmann, Audrey; Abrams, Tinya (2022-03-01). "Exquisite Sensitivity to Dual BRG1/BRM ATPase Inhibitors Reveals Broad SWI/SNF Dependencies in Acute Myeloid Leukemia". Molecular Cancer Research. 20 (3): 361–372. doi:10.1158/1541-7786.MCR-21-0390. ISSN 1557-3125. PMID 34799403. S2CID 244454472.

[:2-11] Xiao, Lanbo; Parolia, Abhijit; Qiao, Yuanyuan; Bawa, Pushpinder; Eyunni, Sanjana; Mannan, Rahul; Carson, Sandra E.; Chang, Yu; Wang, Xiaoju; Zhang, Yuping; Vo, Josh N.; Kregel, Steven; Simko, Stephanie A.; Delekta, Andrew D.; Jaber, Mustapha (January 2022). "Targeting SWI/SNF ATPases in enhancer-addicted prostate cancer". Nature. 601 (7893): 434–439. Bibcode:2022Natur.601..434X. doi:10.1038/s41586-021-04246-z. ISSN 1476-4687. PMC 8770127. PMID 34937944.

[:5-12] Cermakova, Katerina; Tao, Ling; Dejmek, Milan; Sala, Michal; Montierth, Matthew D.; Chan, Yuen San; Patel, Ivanshi; Chambers, Courtney; Loeza Cabrera, Mario; Hoffman, Dane; Parchem, Ronald J.; Wang, Wenyi; Nencka, Radim; Barbieri, Eveline; Hodges, H. Courtney (2023-11-23). "Reactivation of the G1 enhancer landscape underlies core circuitry addiction to SWI/SNF". Nucleic Acids Research. 52 (1): 4–21. doi:10.1093/nar/gkad1081. ISSN 1362-4962. PMC 10783513. PMID 37993417.

[13] Rago, Florencia; Elliott, GiNell; Li, Ailing; Sprouffske, Kathleen; Kerr, Grainne; Desplat, Aurore; Abramowski, Dorothee; Chen, Julie T.; Farsidjani, Ali; Xiang, Kay X.; Bushold, Geoffrey; Feng, Yun; Shirley, Matthew D.; Bric, Anka; Vattay, Anthony (October 2020). "The Discovery of SWI/SNF Chromatin Remodeling Activity as a Novel and Targetable Dependency in Uveal Melanoma". Molecular Cancer Therapeutics. 19 (10): 2186–2195. doi:10.1158/1535-7163.MCT-19-1013. ISSN 1538-8514. PMID 32747420. S2CID 222093985.

[14] Brien, Gerard L.; Remillard, David; Shi, Junwei; Hemming, Matthew L.; Chabon, Jonathon; Wynne, Kieran; Dillon, Eugène T.; Cagney, Gerard; Van Mierlo, Guido; Baltissen, Marijke P.; Vermeulen, Michiel; Qi, Jun; Fröhling, Stefan; Gray, Nathanael S.; Bradner, James E. (2018-11-15). "Targeted degradation of BRD9 reverses oncogenic gene expression in synovial sarcoma". eLife. 7: e41305. doi:10.7554/eLife.41305. ISSN 2050-084X. PMC 6277197. PMID 30431433.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]

[۹]

[۱۰]

[۱۱]

[۱۲]

[۱۳]

[۱۴]