آران‌ای ریبوزومی ۲۳اس: تفاوت میان نسخه‌ها

محتوای حذف‌شده محتوای افزوده‌شده

درخط

نسخهٔ ‏۱۳ اوت ۲۰۲۲، ساعت ۱۴:۲۰

زیرواحد ۲۳اِس ریبوزوم پروکاریوتی در کنار زیرواحد ۵اِس یک جزء 2904 نوکلئوتیدی (در E. coli ) از زیر واحد بزرگ ( 50S) ریبوزوم باکتریایی/آرکی‌ها است و مرکز پپتیدیل ترانسفراز (PTC) را تشکیل می دهد. ^[۲] 23S rRNA به شش حوزه ساختاری ثانویه با عنوان I-VI تقسیم می‌شود که 5S rRNA مربوطه دامنه VII در نظر گرفته می‌شود. ^[۳] فعالیت ریبوزومی پپتیدیل ترانسفراز در دامنه ی V این rRNA قرار دارد، که همچنین رایج ترین محل اتصال آنتی‌بیوتیک هایی است که ترجمه را مهار می کنند و آن را به هدفی برای مهندسی ریبوزومی تبدیل می کند. ^[۲] یکی از اعضای شناخته‌شده ی این گروه آنتی‌بیوتیکی، کلرامفنیکل ، با مهار تشکیل پیوند پپتیدی و بسته به گونه ی ریبوزوم، دو محل اتصال متفاوت را مورد هدف قرار می دهد. جهش های متعدد در دامنه های 23S rRNA با فعالیت پپتیدیل ترانسفراز منجر به مقاومت آنتی بیوتیکی شده است.۳ ژن‌های rRNA 23S معمولاً تغییرات توالی بالاتری از جمله درج‌ها و/یا حذف‌ها در مقایسه با سایر آران‌ای‌های ریبوزومی دارند. ^[۴]

همسان یوکاریوتی rRNA 23S LSU RNA ریبوزومی 28S است و دارای ناحیه‌ای است که با RNA ریبوزومی 5.8S پر شده است. ^[۵]

عملکردها

به‌طور کلی، آران‌ای ریبوزومی یک عملکرد اساسی پپتیدیل ترانسفرازی دارد. هسته ی محرک ریبوزوم در پیکربندی پیوند پپتیدی نقش دارد. هر دو peptidyl-tRNA و aminoacyl-tRNA برای سنتز پروتئین و پاسخ transpeptidation مهم هستند.

در پلاست‌ها

ریبوزوم های کلروپلاست از گیاهان "عالی" دارای آران‌ای ریبوزومی ۴.۵اس اضافی هستند که با تکه‌تکه شدن ۲۳اس ایجاد می شود. در سمت 3' و ۲۳اس در اپرون آران‌ای قرار دارد و مربوط به انتهای 3' ریبوزوم ریبوزومی غیر تکه‌تکه شده است. ^[۶]

جستارهای وابسته

LSU rRNA

منابع

↑ Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 Å resolution". J Mol Biol. 298 (1): 35–59. doi:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID 10756104.
↑ ^۲٫۰ ^۲٫۱ Walker, Allison S.; Russ, William P.; Ranganathan, Rama; Schepartz, Alanna (2020-08-18). "RNA sectors and allosteric function within the ribosome". Proceedings of the National Academy of Sciences (به انگلیسی). 117 (33): 19879–19887. doi:10.1073/pnas.1909634117. ISSN 0027-8424. PMC 7443888. PMID 32747536.
↑ Zerges, William; Hauser, Charles (2009-01-01), Harris, Elizabeth H.; Stern, David B.; Witman, George B. (eds.), "Chapter 28 - Protein Synthesis in the Chloroplast", The Chlamydomonas Sourcebook (Second Edition) (به انگلیسی), London: Academic Press: 967–1025, ISBN 978-0-12-370873-1, retrieved 2021-10-07
↑ Pei, Anna; Nossa, Carlos W.; Chokshi, Pooja; Blaser, Martin J.; Yang, Liying; Rosmarin, David M.; Pei, Zhiheng (5 May 2009). "Diversity of 23S rRNA Genes within Individual Prokaryotic Genomes". PLOS ONE. 4 (5): e5437. Bibcode:2009PLoSO...4.5437P. doi:10.1371/journal.pone.0005437. PMC 2672173. PMID 19415112.
↑ Doris, Stephen M.; Smith, Deborah R.; Beamesderfer, Julia N.; Raphael, Benjamin J.; Nathanson, Judith A.; Gerbi, Susan A. (October 2015). "Universal and domain-specific sequences in 23S–28S ribosomal RNA identified by computational phylogenetics". RNA. 21 (10): 1719–1730. doi:10.1261/rna.051144.115. PMC 4574749. PMID 26283689.
↑ Bieri, P; Leibundgut, M; Saurer, M; Boehringer, D; Ban, N (15 February 2017). "The complete structure of the chloroplast 70S ribosome in complex with translation factor pY". The EMBO Journal. 36 (4): 475–486. doi:10.15252/embj.201695959. PMC 5694952. PMID 28007896.

لینک های خارجی

[pmid10756104-1] Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000). "The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 Å resolution". J Mol Biol. 298 (1): 35–59. doi:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID 10756104.

[:0-2] ۲٫۰ ^۲٫۱ Walker, Allison S.; Russ, William P.; Ranganathan, Rama; Schepartz, Alanna (2020-08-18). "RNA sectors and allosteric function within the ribosome". Proceedings of the National Academy of Sciences (به انگلیسی). 117 (33): 19879–19887. doi:10.1073/pnas.1909634117. ISSN 0027-8424. PMC 7443888. PMID 32747536.

[3] Zerges, William; Hauser, Charles (2009-01-01), Harris, Elizabeth H.; Stern, David B.; Witman, George B. (eds.), "Chapter 28 - Protein Synthesis in the Chloroplast", The Chlamydomonas Sourcebook (Second Edition) (به انگلیسی), London: Academic Press: 967–1025, ISBN 978-0-12-370873-1, retrieved 2021-10-07

[4] Pei, Anna; Nossa, Carlos W.; Chokshi, Pooja; Blaser, Martin J.; Yang, Liying; Rosmarin, David M.; Pei, Zhiheng (5 May 2009). "Diversity of 23S rRNA Genes within Individual Prokaryotic Genomes". PLOS ONE. 4 (5): e5437. Bibcode:2009PLoSO...4.5437P. doi:10.1371/journal.pone.0005437. PMC 2672173. PMID 19415112.

[5] Doris, Stephen M.; Smith, Deborah R.; Beamesderfer, Julia N.; Raphael, Benjamin J.; Nathanson, Judith A.; Gerbi, Susan A. (October 2015). "Universal and domain-specific sequences in 23S–28S ribosomal RNA identified by computational phylogenetics". RNA. 21 (10): 1719–1730. doi:10.1261/rna.051144.115. PMC 4574749. PMID 26283689.

[CompleteRibo-6] Bieri, P; Leibundgut, M; Saurer, M; Boehringer, D; Ban, N (15 February 2017). "The complete structure of the chloroplast 70S ribosome in complex with translation factor pY". The EMBO Journal. 36 (4): 475–486. doi:10.15252/embj.201695959. PMC 5694952. PMID 28007896.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]