ATG13

ATG13
ساختارهای موجود PDB جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB فهرست شناسه‌های PDB 5C50
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	ATG13, KIAA0652, PARATARG8, autophagy related 13
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 615088 MGI: 1196429 HomoloGene: 32229 GeneCards: ATG13
موقعیت ژن (موش) کروموزوم کروموزوم ۲ (موش) نوار 2|2 E1 شروع 91,504,963 bp پایان 91,540,921 bp
هستی‌شناسی ژن عملکرد ملکولی • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی • protein kinase binding ترکیبات سلولی • سیتوپلاسم • سیتوزول • Atg1/ULK1 kinase complex • میتوکندری • phagophore assembly site • endoplasmic reticulum membrane فرایند زیستی • خودخواری • macroautophagy • autophagosome assembly • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • mitophagy • response to mitochondrial depolarisation • regulation of macroautophagy منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌ها	انسان	موش
Entrez	9776	51897
آنسامبل	ENSG00000175224	ENSMUSG00000027244
یونی‌پروت	O75143	Q91YI1
RefSeq (mRNA)	NM_001205119، NM_001205120، NM_001205121، NM_001205122، NM_001346311، NM_001346312، NM_001346313، NM_001346314، NM_001346315، NM_001346316، NM_001346317، NM_001346318، NM_001346319، NM_001346320، NM_001346321، NM_001346322، NM_001346323، NM_001346324، NM_001346325، NM_001346326، NM_001346327، NM_001346328، NM_001346329، NM_001346330، NM_001346331، NM_001346332، NM_001346333، NM_001346334، NM_001346335، NM_001346336، NM_001346337، NM_001346338، NM_001346340، NM_001346342، NM_001346344، NM_001346346، NM_001346348، NM_001346349، NM_001346350، NM_001346351، NM_001346352، NM_001346353، NM_001346354، NM_001346355، NM_001346356، NM_001346357، NM_001346358، NM_001346359، NM_001346360، NM_014741، NR_144422، NR_144423، NR_144424 NM_001142673، NM_001205119، NM_001205120، NM_001205121، NM_001205122، NM_001346311، NM_001346312، NM_001346313، NM_001346314، NM_001346315، NM_001346316، NM_001346317، NM_001346318، NM_001346319، NM_001346320، NM_001346321، NM_001346322، NM_001346323، NM_001346324، NM_001346325، NM_001346326، NM_001346327، NM_001346328، NM_001346329، NM_001346330، NM_001346331، NM_001346332، NM_001346333، NM_001346334، NM_001346335، NM_001346336، NM_001346337، NM_001346338، NM_001346340، NM_001346342، NM_001346344، NM_001346346، NM_001346348، NM_001346349، NM_001346350، NM_001346351، NM_001346352، NM_001346353، NM_001346354، NM_001346355، NM_001346356، NM_001346357، NM_001346358، NM_001346359، NM_001346360، NM_014741، NR_144422، NR_144423، NR_144424	XM_006499892، NM_001355416، NM_001355417، NM_001355418، NM_001355419، NM_001355420، NM_001355421 NM_145528، XM_006499892، NM_001355416، NM_001355417، NM_001355418، NM_001355419، NM_001355420، NM_001355421
RefSeq (پروتئین)	NP_001192048، NP_001192049، NP_001192050، NP_001192051، NP_001333240، NP_001333241، NP_001333242، NP_001333243، NP_001333244، NP_001333245، NP_001333246، NP_001333247، NP_001333248، NP_001333249، NP_001333250، NP_001333251، NP_001333252، NP_001333253، NP_001333254، NP_001333255، NP_001333256، NP_001333257، NP_001333258، NP_001333259، NP_001333260، NP_001333261، NP_001333262، NP_001333263، NP_001333264، NP_001333265، NP_001333266، NP_001333267، NP_001333269، NP_001333271، NP_001333273، NP_001333275، NP_001333277، NP_001333278، NP_001333279، NP_001333280، NP_001333281، NP_001333282، NP_001333283، NP_001333284، NP_001333285، NP_001333286، NP_001333287، NP_001333288، NP_001333289، NP_055556، XP_005253322، XP_005253323، XP_005253325، XP_006718459، XP_011518795، XP_011518798، XP_011518801، XP_011518802، XP_011518804، XP_016874088، XP_016874092، XP_016874096، XP_016874107، XP_024304549 NP_001136145، NP_001192048، NP_001192049، NP_001192050، NP_001192051، NP_001333240، NP_001333241، NP_001333242، NP_001333243، NP_001333244، NP_001333245، NP_001333246، NP_001333247، NP_001333248، NP_001333249، NP_001333250، NP_001333251، NP_001333252، NP_001333253، NP_001333254، NP_001333255، NP_001333256، NP_001333257، NP_001333258، NP_001333259، NP_001333260، NP_001333261، NP_001333262، NP_001333263، NP_001333264، NP_001333265، NP_001333266، NP_001333267، NP_001333269، NP_001333271، NP_001333273، NP_001333275، NP_001333277، NP_001333278، NP_001333279، NP_001333280، NP_001333281، NP_001333282، NP_001333283، NP_001333284، NP_001333285، NP_001333286، NP_001333287، NP_001333288، NP_001333289، NP_055556، XP_005253322، XP_005253323، XP_005253325، XP_006718459، XP_011518795، XP_011518798، XP_011518801، XP_011518802، XP_011518804، XP_016874088، XP_016874092، XP_016874096، XP_016874107، XP_024304549	XP_006499955، NP_001342345، NP_001342346، NP_001342347، NP_001342348، NP_001342349، NP_001342350 NP_663503، XP_006499955، NP_001342345، NP_001342346، NP_001342347، NP_001342348، NP_001342349، NP_001342350
موقعیت (UCSC)	ن/م	Chr : 91.5 – 91.54 Mb
جستجوی PubMed
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان مشاهده/ویرایش موش

پروتئین ۱۳ مرتبط با خودخواری (انگلیسی: Autophagy-related protein 13) که با نام اختصاری «ATG13» شناخته می‌شود، یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «KIAA0652» کُدگذاری می‌شود. این پروتئین یک فاکتور خودخواری است که برای تشکیل فاگوزوم لازم است و یکی از اهداف مولکولی مسیر mTOR است که در تنظیم فرایند خودخواری نقش دارد.

منابع

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «Autophagy-related protein 13». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۱۴ اکتبر ۲۰۲۲.

برای مطالعهٔ بیشتر

• Hosokawa N, Sasaki T, Iemura S, et al. (2009). "Atg101, a novel mammalian autophagy protein interacting with Atg13". Autophagy. 5 (7): 973–9. doi:10.4161/auto.5.7.9296. PMID 19597335.
• Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). "Large-Scale Concatenation cDNA Sequencing". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
• Chan EY (2009). "mTORC1 phosphorylates the ULK1-mAtg13-FIP200 autophagy regulatory complex". Science Signaling. 2 (84): pe51. doi:10.1126/scisignal.284pe51. PMID 19690328. S2CID 206673207.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
• Jung CH, Jun CB, Ro SH, et al. (2009). "ULK-Atg13-FIP200 Complexes Mediate mTOR Signaling to the Autophagy Machinery". Mol. Biol. Cell. 20 (7): 1992–2003. doi:10.1091/mbc.E08-12-1249. PMC 2663920. PMID 19225151.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
• Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
• Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). "A "double adaptor" method for improved shotgun library construction". Anal. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, et al. (1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. X. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093/dnares/5.3.169. PMID 9734811.
• Chan EY, Longatti A, McKnight NC, Tooze SA (2009). "Kinase-Inactivated ULK Proteins Inhibit Autophagy via Their Conserved C-Terminal Domains Using an Atg13-Independent Mechanism". Mol. Cell. Biol. 29 (1): 157–71. doi:10.1128/MCB.01082-08. PMC 2612494. PMID 18936157.
• Ganley IG, Lam du H, Wang J, et al. (2009). "ULK1·ATG13·FIP200 Complex Mediates mTOR Signaling and Is Essential for Autophagy". J. Biol. Chem. 284 (18): 12297–305. doi:10.1074/jbc.M900573200. PMC 2673298. PMID 19258318.
• Sinzelle L, Kapitonov VV, Grzela DP, et al. (2008). "Transposition of a reconstructed Harbinger element in human cells and functional homology with two transposon-derived cellular genes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 (12): 4715–20. doi:10.1073/pnas.0707746105. PMC 2290759. PMID 18339812.

پیوند به بیرون

• مکان ژنوم ATG13 انسانی و صفحهٔ جزئیات ژنی ATG13 در سامانه جستجوی بانک ژنی دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز.