فهرست مدل‌های شبیه‌سازی کووید-۱۹

از ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد

توجه داشته باشید که برخی از برنامه‌های ذکر شده فقط مدل‌ها یا شبیه‌سازهای وبگاهی هستند و برخی از آنها به داده‌های بیدرنگ منابع دیگر اعتماد دارند (یا از آنها استفاده می‌کنند).

مدل‌هایی با بیشترین پشتوانه علمی[ویرایش]

لیست فرعی شامل شبیه‌سازهایی است که براساس مدل‌های نظری ساخته شده‌اند. با توجه به تعداد بالای تحقیقات پیش از چاپ ایجاد و راه‌اندازی شده توسط دنیاگیری کوید-۱۹،[۱] مخصوصاً مدل‌های جدیدتر فقط باید با موشکافی علمی بیشتری در نظر گرفته شوند.[۲][۳][۴]

شبیه‌سازی‌ها و مدل‌ها[ویرایش]

پایگاه‌داده ژنوم[ویرایش]

چندین مورد از این مدل‌ها از پایگاه داده‌های ژنوم استفاده می‌کنند، از جمله موارد زیر:

کنسرسیوم، خوشه‌های تحقیق، مجموعه‌های دیگر[ویرایش]

  • لیست سی‌دی‌سی شامل پیش‌بینی و فرضیات[۴۳] - فهرست بزرگ با مدل‌های مختلف و غیره
  • CORSMA - کنسرسیوم اتحادیه اروپا (کووید-۱۹-شیوع پاسخ ترکیبی از سلامت الکترونیکی، سرولوژی، مدل‌سازی، هوش مصنوعی و تحقیقات پیاده‌سازی)[۴۴]
  • مرکز پیش‌بینی کووید-۱۹[۴۵] - به عنوان مخزن مرکزی پیش‌بینی‌ها و پیش‌گویی‌های بیش از ۵۰ گروه تحقیقاتی بین‌المللی عمل می‌کند.[۴۶][۴۷]
  • نکس‌اسنرین - پروژه منبع باز برای استفاده از توان علمی و بهداشت عمومی داده‌های ژنوم پاتوژن[۴۸]
    • همچنین به منابع نکس‌استرین سارس-کوو-۲ مراجعه کنید[۴۹]
  • اس‌آی‌ام‌آی‌دی[۵۰] - مدل‌های شبیه‌سازی بیماری‌های عفونی - کنسرسیوم تحقیقاتی بلژیک
  • آرای‌ام‌پی - کمک سریع در مدل‌سازی موارد دنیاگیری[۵۱] (انگلستان)
  • کنسرسیوم مدل‌سازی UT Austin کووید-۱۹[۵۲]

نمایشگرها، مدل‌ها یا پیشخوان‌های واکسیناسیون[ویرایش]

مدل‌هایی که پشتوانه علمی کمتری دارند[ویرایش]

مدل‌های زیر فقط برای اهداف آموزشی است.

  • شبیه‌ساز کووید-۱۹[۶۱]
  • کووید۱۹: ۷ مورد برتر - فهرست برگزیده[۶۲] در مدیوم ارسال شده‌است[۶۳]
  • github.com/ موضوعات: کووید-۱۹[۶۴]
  • شبیه‌ساز آی‌اس‌ئی‌ئی سیستمز کوید-۱۹[۶۵]
  • nCoV2019.live[۶۶] - «اعدادی که با یک نگاه سریع به آنها نیاز دارید» توسط شیفمن / کانلون
    • cov19.cc- توسط کانلون[۶۷]
  • سیمول۸ - منابع شبیه‌سازی کووید-۱۹[۶۸]
  • شبیه‌سازی ویروس کرونا با مدل SIR[۶۹]
  • شبیه‌سازی گسترش ویروس[۷۰]

سایر شبیه‌سازی‌ها، مدل‌ها یا منابع داده مرتبط[ویرایش]

  • (انجمن شیمی آمریکا) جستجوگر نشانگر زیستی کووید-۱۹ سی‌ای‌اس (به انگلیسی: CAS COVID-19 BIOINDICATOR EXPLORER)[۷۱]
  • ردیاب داده کووید سی‌دی‌سی[۷۲]
  • شرکای جامعه مدنی در همبستگی علیه کووید-۱۹ (CSPAC): گزارش وضعیت کامل، زنده، جهانی، کووید-۱۹ برای ۲۵۱ منطقه و ۷۱ کشتی[۷۳]
  • مؤسسه تحقیقات اجتماعی و اقتصادی کرنل (CISER): منابع داده کووید-۱۹[۷۴]
  • مدل‌سازی چند فاز اولری - لاگرانژی، به عنوان مثال برای انتقال کووید-۱۹ در آسانسورها بر اساس سی‌اف‌دی[۷۵]
  • ویروس کرونا منبع داده دنیای ما درداده[۷۶]
  • پروژه رهگیری کووید ۱۹ اقیانوس اطلس[۷۷]
  • ودر (به انگلیسی: Vadere) - چارچوبی منبع باز برای شبیه‌سازی عابرپیاده و جمعیت[۷۸]
  • داشبورد هو کروناویروس (کووید-۱۹)[۷۹]

یادگیری‌ها و منابع دیگر[ویرایش]

خواندن بیشتر[ویرایش]

جستارهای وابسته[ویرایش]

منابع[ویرایش]

  1. Brierley L. "The role of research preprints in the academic response to the COVID-19 epidemic". doi:10.22541/au.158516578.89167184.
  2. "Another 178,000 deaths? Scientists' latest virus projection is a warning". NBC News. Retrieved 2021-02-22.
  3. "Don't Believe the COVID-19 Models". The Atlantic. 2020-04-02. Retrieved 2021-02-22.
  4. "Epidemic Modeling 102: All CoVID-19 models are wrong, but some are useful". Medium. 2020-09-09. Retrieved 2021-02-22.
  5. Chen TM, Rui J, Wang QP, Zhao ZY, Cui JA, Yin L (February 2020). "A mathematical model for simulating the phase-based transmissibility of a novel coronavirus". Infectious Diseases of Poverty. 9 (1): 24. doi:10.1186/s40249-020-00640-3. PMC 7047374 Check |pmc= value (help). PMID 32111262.
  6. CoSim19 shiny.covid-simulator.com
  7. COVID-19 MOBILITY MODELING covid-mobility.stanford.edu
  8. Chang S, Pierson E, Koh PW, Gerardin J, Redbird B, Grusky D, Leskovec J (January 2021). "Mobility network models of COVID-19 explain inequities and inform reopening". Nature. 589 (7840): 82–87. Bibcode:2021Natur.589...82C. doi:10.1038/s41586-020-2923-3. PMID 33171481 Check |pmid= value (help).
  9. COVID-19 Simulator covid19sim.org
  10. "Policy Simulator Methodology". COVID-19 Simulator. Retrieved 2021-02-21.
  11. COVID-19 Surge www.cdc.gov
  12. CDC (2020-02-11). "Healthcare Workers". Centers for Disease Control and Prevention. Retrieved 2021-02-22.
  13. COVIDSIM www.markusng.com
  14. CovidSim www.hm.edu
  15. COVIDSim github.com/nkymark
  16. nkymark/COVIDSim, 2020-12-23, retrieved 2021-03-09
  17. Ng KY, Gui MM (October 2020). "COVID-19: Development of a robust mathematical model and simulation package with consideration for ageing population and time delay for control action and resusceptibility". Physica D. Nonlinear Phenomena. 411: 132599. Bibcode:2020PhyD..41132599N. doi:10.1016/j.physd.2020.132599. PMC 7282799 Check |pmc= value (help). PMID 32536738.
  18. CovidSIM.eu covidsim.eu
  19. "CovidSIM". covidsim.eu. Retrieved 2021-03-13.
  20. Schneider KA, Ngwa GA, Schwehm M, Eichner L, Eichner M (November 2020). "The COVID-19 pandemic preparedness simulation tool: CovidSIM". BMC Infectious Diseases. 20 (1): 859. doi:10.1186/s12879-020-05566-7. PMC 7675392 Check |pmc= value (help). PMID 33213360 Check |pmid= value (help).
  21. CovRadar covradar.net
  22. الگو:Cite biorxiv
  23. "Molecular surveillance of SARS-CoV-2 spike protein mutations using CovRadar". News-Medical.net. 2021-02-07. Retrieved 2021-04-25.
  24. "Dr. Ghaffarzadegan's model - Simulate your university's covid-19 cases". forio.com. Retrieved 2 May 2021.
  25. Ghaffarzadegan N (2021-02-01). "Simulation-based what-if analysis for controlling the spread of Covid-19 in universities". PLOS ONE. 16 (2): e0246323. doi:10.1371/journal.pone.0246323. PMC 7850497 Check |pmc= value (help). PMID 33524045 Check |pmid= value (help).
  26. "COVID-19 simulation model creates scenarios". www.vtnews.vt.edu. Retrieved 2021-02-21.
  27. Event Horizon - COVID-19 rocs.hu-berlin.de
  28. Maier BF, Brockmann D (May 2020). "Effective containment explains subexponential growth in recent confirmed COVID-19 cases in China". Science. 368 (6492): 742–746. Bibcode:2020Sci...368..742M. doi:10.1126/science.abb4557. PMC 7164388 Check |pmc= value (help). PMID 32269067.
  29. Evolutionary AI evolution.ml
  30. "Evolutionary AI". evolution.ml. Retrieved 2021-04-26.
  31. A bot will complete this citation soon. Click here to jump the queue arXiv:[۱].
  32. ۳۲٫۰ ۳۲٫۱ "Can Computer Models Select the Best Public Health Interventions for COVID-19?". IEEE Spectrum: Technology, Engineering, and Science News. Retrieved 2021-04-26.
  33. OxCGRT www.bsg.ox.ac.uk
  34. "COVID-19 Government Response Tracker". www.bsg.ox.ac.uk. Retrieved 2021-04-26.
  35. SC-COSMO www.sc-cosmo.org
  36. Khailaie, Sahamoddin; Mitra, Tanmay; Bandyopadhyay, Arnab; Schips, Marta; Mascheroni, Pietro; Vanella, Patrizio; Lange, Berit; Binder, Sebastian; Meyer-Hermann, Michael (2020-04-07). "Estimate of the development of the epidemic reproduction number Rt from Coronavirus SARS-CoV-2 case data and implications for political measures based on prognostics". medRxiv: 2020.04.04.20053637. doi:10.1101/2020.04.04.20053637. |hdl-access= requires |hdl= (help)
  37. "simm / covid19 / SECIR". GitLab. Retrieved 2021-07-05.
  38. "Report · Wiki · simm / covid19 / SECIR". GitLab. Retrieved 2021-07-05.
  39. "Our research". Helmholtz Centre for Infection Research. Retrieved 2021-07-05.
  40. - Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigationcorona-lab.ch, accessed 28 April 2021
  41. Gorji H, Arnoldini M, Jenny DF, Hardt WD, Jenny P (2020-12-02). "Smart Investment of Virus RNA Testing Resources to Enhance Covid-19 Mitigation". doi:10.1101/2020.11.30.20239566.
  42. Epidemiology Collection epubs.siam.org
  43. CDC list of Forecast Inclusion and Assumptions www.cdc.gov
  44. "CORESMA". CORESMA. Retrieved 2021-07-05.
  45. COVID-19 Forecast Hub
  46. "Where The Latest COVID-19 Models Think We're Headed — And Why They Disagree". FiveThirtyEight. 2020-05-01. Retrieved 2021-02-21.
  47. "Home - COVID 19 forecast hub". covid19forecasthub.org. Retrieved 2021-02-21.
  48. "Nextstrain". nextstrain.org. Retrieved 2021-04-26.
  49. Nextstrain SARS-CoV-2 resources nextstrain.org/sars-cov-2
  50. SIMID www.simid.be
  51. "Rapid Assistance in Modelling the Pandemic: RAMP | Royal Society". royalsociety.org. Retrieved 2021-03-09.
  52. UT Austin COVID-19 Modeling Consortium covid-19.tacc.utexas.edu
  53. COVID-19 Dashboard coronavirus.jhu.edu
  54. "COVID-19 Map". Johns Hopkins Coronavirus Resource Center. Retrieved 2021-04-26.
  55. Dong, Ensheng; Du, Hongru; Gardner, Lauren (2020-05-01). "An interactive web-based dashboard to track COVID-19 in real time". The Lancet Infectious Diseases (به English). 20 (5): 533–534. doi:10.1016/S1473-3099(20)30120-1. ISSN 1473-3099. PMC 7159018 Check |pmc= value (help). PMID 32087114.
  56. Datopian; Open Knowledge International. "Novel Coronavirus 2019". DataHub.io. Retrieved 2021-05-02.
  57. datasets/covid-19, Data Packaged Core Datasets at GitHub, 2021-05-02, retrieved 2021-05-02
  58. Gesundheit, Bundesministerium für. "Das offizielle Dashboard zur Impfkampagne der Bundesrepublik Deutschland". impfdashboard.de (به آلمانی). Retrieved 2021-06-07.
  59. Simulation der COVID19-Impfkampagne
  60. COVID-19 Projections covid19.healthdata.org
  61. Covid-19 Simulator www.coronasimulator.com, accessed 28 April 2021
  62. COVID19: Top 7 - A curated list towardsdatascience.com
  63. "COVID19: Top 7 online interactive simulations, curated". Medium. 2020-05-03. Retrieved 2021-02-21.
  64. covid-19 github.com/topics
  65. COVID-19 Simulator exchange.iseesystems.com
  66. nCoV2019.live ncov2019.live
  67. cov19.cc
  68. "COVID-19 Simulation Resources". Retrieved 2020-02-21.
  69. Simulating coronavirus with the SIR model fatiherikli.github.io
  70. Virus Spread Simulation c19model.com
  71. "CAS COVID-19 Resources". CAS. Retrieved 2021-06-02.
  72. COVID Data Tracker covid.cdc.gov
  73. "Full, live, global, COVID-19 Status Report for 251 locales & 71 Ships". civilsocietysolidarityagainstcovid19.com. Retrieved 2021-07-01.
  74. COVID-19 Data Sources guides.library.cornell.edu
  75. Dbouk T, Drikakis D (January 2021). "On airborne virus transmission in elevators and confined spaces". Physics of Fluids. 33 (1): 011905. Bibcode:2021PhFl...33a1905D. doi:10.1063/5.0038180. PMC 7984422 Check |pmc= value (help). PMID 33790526 Check |pmid= value (help).
  76. Coronavirus Source Data ourworldindata.org
  77. COVID 19 Tracking Project covidtracking.com
  78. Vadere - Open Source Framework for Pedestrian and Crowd Simulation www.vadere.org
  79. "WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard". covid19.who.int. Retrieved 2021-07-01.
  80. Prabha, S.; Karthikeyan, P.; Kamalanand, K.; Selvaganesan, N. (2021-07-07). Computational Modelling and Imaging for SARS-CoV-2 and COVID-19 (1 ed.). Boca Raton: CRC Press. doi:10.1201/9781003142584. ISBN 978-1-00-314258-4.
  81. "Fighting a Pandemic with Medical Imaging and Machine Learning: Lessons Learned from COVID-19". SIAM News. Retrieved 2021-06-02.