فنومیک

فنومیک مطالعه سیستماتیک صفاتی است که یک فنوتیپ را تشکیل می‌دهند.^[۱] این موضوع توسط دانشمند دانشگاه کالیفرنیا برکلی و استیون آ. گاران، دانشمند LBNL ابداع شد.^[۲]^[۳]^[۴] به این ترتیب، این یک حوزه پژوهشی فرارشته‌ای است که شامل زیست‌شناسی، علوم داده، مهندسی و دیگر زمینه‌ها می‌شود. فنومیک به اندازه‌گیری فنوتیپ مربوط می‌شود که در آن یک پدیده مجموعه‌ای از صفات (ویژگی‌های فیزیکی و بیوشیمیایی) است که می‌تواند توسط یک جاندار در طول دوره رشد و در پاسخ به جهش ژنتیکی و تأثیر محیطی تولید شود. رابطه بین فنوتیپ و ژنوتیپ به پژوهشگران این توانایی را می‌دهد تا چندنمودی را درک و مطالعه کنند.^[۵] مفاهیم فنومیک در ژنومیک عملکردی، تحقیقات دارویی، مهندسی متابولیک، تحقیقات کشاورزی و به‌طور فزاینده‌ای در تبارزایی استفاده می‌شود.^[۶]

چالش‌های فنی شامل بهبود، هم از نظر کمی و هم از نظر کیفی، ظرفیت اندازه‌گیری پدیده‌ها است.^[۵]

منابع[ویرایش]

↑ Bilder, R.M.; Sabb, F.W.; Cannon, TD; London, ED; Jentsch, JD; Parker, DS; Poldrack, RA; Evans, C; Freimer, NB (2009). "Phenomics: The systematic study of phenotypes on a genome-wide scale". Neuroscience. 164 (1): 30–42. doi:10.1016/j.neuroscience.2009.01.027. PMC 2760679. PMID 19344640.
↑ TODAY AT BERKELEY LAB (Aug 5, 2011). "Garan is a leading scientist in the field of aging research, best known for coining the term "phenomics" to describe the comprehensive study of phenotypes". TODAY AT BERKELEY LAB. Retrieved 2021-05-29.
↑ Jin, Li (2021-02-01). "Welcome to the Phenomics Journal". Phenomics (به انگلیسی). 1 (1): 1–2. doi:10.1007/s43657-020-00009-4. ISSN 2730-5848. PMC 9584128. PMID 36939790.
↑ Guanghui, Yu; Xuanjun, Fang (2009). "Concept of phenomics and its development in plant science". Molecular Plant Breeding. ISSN 1672-416X. Archived from the original on 3 June 2021. Retrieved 26 August 2023 – via The Food and Agriculture Organization (FAO) is a specialized agency of the United Nations.
↑ ^۵٫۰ ^۵٫۱ Houle, David; Govindaraju, Diddahally R.; Omholt, Stig (2010). "Phenomics: the next challenge". Nature Reviews Genetics. 11 (12): 855–866. doi:10.1038/nrg2897. PMID 21085204.
↑ O'Leary, M. A.; Bloch, J. I.; Flynn, J. J.; Gaudin, T. J.; Giallombardo, A.; Giannini, N. P.; Goldberg, S. L.; Kraatz, B. P.; Luo, Z. -X. (2013). "The placental mammal ancestor and the post-K-Pg radiation of placentals". Science. 332 (6120): 662–667. Bibcode:2013Sci...339..662O. doi:10.1126/science.1229237. PMID 23393258. {{cite journal}}: |hdl-access= requires |hdl= (help)

[BilderSabbCannon2009-1] Bilder, R.M.; Sabb, F.W.; Cannon, TD; London, ED; Jentsch, JD; Parker, DS; Poldrack, RA; Evans, C; Freimer, NB (2009). "Phenomics: The systematic study of phenotypes on a genome-wide scale". Neuroscience. 164 (1): 30–42. doi:10.1016/j.neuroscience.2009.01.027. PMC 2760679. PMID 19344640.

[2] TODAY AT BERKELEY LAB (Aug 5, 2011). "Garan is a leading scientist in the field of aging research, best known for coining the term "phenomics" to describe the comprehensive study of phenotypes". TODAY AT BERKELEY LAB. Retrieved 2021-05-29.

[3] Jin, Li (2021-02-01). "Welcome to the Phenomics Journal". Phenomics (به انگلیسی). 1 (1): 1–2. doi:10.1007/s43657-020-00009-4. ISSN 2730-5848. PMC 9584128. PMID 36939790.

[4] Guanghui, Yu; Xuanjun, Fang (2009). "Concept of phenomics and its development in plant science". Molecular Plant Breeding. ISSN 1672-416X. Archived from the original on 3 June 2021. Retrieved 26 August 2023 – via The Food and Agriculture Organization (FAO) is a specialized agency of the United Nations.

[HouleGovindaraju2010-5] ۵٫۰ ^۵٫۱ Houle, David; Govindaraju, Diddahally R.; Omholt, Stig (2010). "Phenomics: the next challenge". Nature Reviews Genetics. 11 (12): 855–866. doi:10.1038/nrg2897. PMID 21085204.

[6] O'Leary, M. A.; Bloch, J. I.; Flynn, J. J.; Gaudin, T. J.; Giallombardo, A.; Giannini, N. P.; Goldberg, S. L.; Kraatz, B. P.; Luo, Z. -X. (2013). "The placental mammal ancestor and the post-K-Pg radiation of placentals". Science. 332 (6120): 662–667. Bibcode:2013Sci...339..662O. doi:10.1126/science.1229237. PMID 23393258. {{cite journal}}: |hdl-access= requires |hdl= (help)

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]