الگو:Pfam box

از ویکی‌پدیا، دانشنامهٔ آزاد
Pfam box
شناسه‌ها
نماد؟
توضیحات الگو[نمایش] [ویرایش] [تاریخچه] [پاکسازی]

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

استفاده[ویرایش]

To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.

{{Infobox protein family
| class = <!-- to save space: collapsible collapsed -->
| Symbol = 
| Name = 
| image = 
| caption = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
| Membranome superfamily =
| Membranome family =
}}

نمونه[ویرایش]

The following filled in Pfam infobox template produces the information box to the right.

Ligand-binding domain (LBD)
RORC 3L0L.png
شناسه‌ها
نمادHormone_recep
پی‌فمPF00104
اینترپروIPR000536
SMARTSM00430
CATH1lbd
SCOPe1lbd / SUPFAM
سی‌دی‌دیcd06157
{{Pfam box
| Symbol = Hormone_recep
| class = collapsible
| Name = Ligand-binding domain (LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]] ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}

Maintenance[ویرایش]

TemplateData[ویرایش]

این توضیحاتِ داده‌های الگو این الگو است که توسط ویرایشگر دیداری و دیگر ابزارها استفاده می‌شود.

Pfam box

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

پارامترهای الگو

پارامترتوضیحاتنوعوضعیت
SymbolSymbol

بدون توصیف

خطاختیاری
NameName

بدون توصیف

خطاختیاری
Imageimage

fill in "NONE" if not needed to suppress the tracking category

پروندهاختیاری
Widthwidth

Width for image

رشتهاختیاری
Captioncaption

Caption for image

رشتهاختیاری
InterPro family identifierInterPro

بدون توصیف

ناشناختهاختیاری
Pfam family identifierPfam

Auto-links to Pfam family record

خطاختیاری
Pfam clan identifierPfam_clan

Auto-links to Pfam clan record; a clan is a group of related families (~superfamily).

خطاختیاری
Interpro identifierInterpro

Auto-links to an Interpro entry

خطاختیاری
SMART accession numberSMART

Auto-links to a domain entry in the Simple Modular Architecture Research Tool

خطاختیاری
PROSITE record identifierPROSITE

Auto-links to a PROSITE record search

خطاختیاری
MEROPS record identifierMEROPS

Auto-links to a MEROPS record (MEROPS is scoped to peptidases and their inhibitors)

خطاختیاری
SCOP (domain/PDB accession number)SCOP

Given a PDB accession number or SCOP domain name, auto-links to a SCOP and a SUPFAMpage.

خطاختیاری
CATH (domain/PDB accession number)CATH

Given a CATH domain ID or a PDB accession number, auto-links to CATH (Classification of Protein Structural Domains).

خطاختیاری
TCDB identifierTCDB

Auto-links to an identifier search in the Transporter Classification Database

خطاختیاری
OPM superfamily identifierOPM family

Auto-links to a superfamily record in the database of Orientations of Proteins in Membranes.

خطاختیاری
OPM protein identifierOPM protein

Value will typically be a PDB identifier; auto-links to a protein record in the database of Orientations of Proteins in Membranes

خطاختیاری
CAZy family identifierCAZy

Auto-links to a family description page in the database of Carbohydrate-Active enZYmes.

خطاختیاری
CDD uidCDD

Auto-links to a record in the Conserved Domain Database

خطاختیاری
alignalign

بدون توصیف

ناشناختهاختیاری
image_sizeimage_size

بدون توصیف

ناشناختهاختیاری
altalt

بدون توصیف

ناشناختهاختیاری
Membranome superfamilyMembranome superfamily

بدون توصیف

ناشناختهاختیاری
Membranome familyMembranome family

بدون توصیف

ناشناختهاختیاری
classclass

infobox class

مثال
collapsible collapsed
ناشناختهاختیاری
belowbelow

footnotes

ناشناختهاختیاری
PDBPDB

PDB examples. Only use if all of: no image is available, no CATH/SCOP examples, InterPro or PDB search fails.

محتوامنسوخ‌شده