پروتئین اتصال‌دهنده ایمونوگلوبولین: تفاوت میان نسخه‌ها

HSPA5
ساختارهای موجود
PDB	جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
فهرست شناسه‌های PDB
	3IUC, 3LDL, 3LDN, 3LDO, 3LDP, 5E84, 5E86, 5E85, 5F1X, 5EX5, 5EVZ, 5F2R, 5F0X, 5EY4, 5EXW
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	HSPA5, BIP, GRP78, HEL-S-89n, MIF2, Binding immunoglobulin protein, heat shock protein family A (Hsp70) member 5, GRP78/Bip
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 138120 MGI: 95835 HomoloGene: 3908 GeneCards: HSPA5
موقعیت ژن (موش)
کروموزوم	کروموزوم ۲ (موش)
پایان	34,667,559 bp
الگوی گسترش RNA
	More reference expression data
هستی‌شناسی ژن
عملکرد ملکولی	• nucleotide binding; • calcium ion binding; • chaperone binding; • protein domain specific binding; • ribosome binding; • misfolded protein binding; • ATPase activity; • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی; • enzyme binding; • ATP binding; • ubiquitin protein ligase binding; • unfolded protein binding; • cadherin binding; • hydrolase activity; • heat shock protein binding; • protein folding chaperone activity;
ترکیبات سلولی	• سیتوپلاسم; • endoplasmic reticulum lumen; • endoplasmic reticulum membrane; • membrane; • focal adhesion; • melanosome; • myelin sheath; • پوسته یاخته; • smooth endoplasmic reticulum; • endoplasmic reticulum chaperone complex; • cell surface; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • midbody; • شبکه آندوپلاسمی; • میتوکندری; • COP9 signalosome; • extracellular exosome; • هسته یاخته; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; • GO:0005578 بافت‌مانه برون‌یاخته‌ای; • سیتوزول; • GO:0009327 protein-containing complex; • intracellular membrane-bounded organelle;
فرایند زیستی	• cellular response to interleukin-4; • regulation of ATF6-mediated unfolded protein response; • cellular response to glucose starvation; • regulation of protein folding in endoplasmic reticulum; • substantia nigra development; • positive regulation of cell migration; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress; • maintenance of protein localization in endoplasmic reticulum; • negative regulation of apoptotic process; • protein folding in endoplasmic reticulum; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • toxin transport; • response to endoplasmic reticulum stress; • PERK-mediated unfolded protein response; • cerebellum structural organization; • ER overload response; • endoplasmic reticulum unfolded protein response; • ATF6-mediated unfolded protein response; • IRE1-mediated unfolded protein response; • cerebellar Purkinje cell layer development; • regulation of PERK-mediated unfolded protein response; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • GO:1904577 cellular response to antibiotic; • negative regulation of protein homodimerization activity; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • cellular response to manganese ion; • positive regulation of protein ubiquitination; • regulation of IRE1-mediated unfolded protein response; • response to radiation; • positive regulation of neuron projection development; • neuron differentiation; • response to cocaine; • neuron apoptotic process; • cellular response to calcium ion; • cellular response to cAMP; • stress response to metal ion; • response to methamphetamine hydrochloride; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • cellular response to gamma radiation; • luteolysis; • response to unfolded protein; • cellular response to heat; • Unfolded Protein Response; • protein refolding; • chaperone cofactor-dependent protein refolding; • negative regulation of IRE1-mediated unfolded protein response; • posttranslational protein targeting to membrane, translocation;
	منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
	3309
	14828
	ENSG00000044574
	ENSMUSG00000026864
	P11021
	P20029
	NM_005347
	NM_022310 NM_001163434، NM_022310
	NP_005338
	NP_071705 NP_001156906، NP_071705
	ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان	مشاهده/ویرایش موش

تفاوت جدیدتر ←

محتوای حذف‌شده محتوای افزوده‌شده

دیداریویکی‌متن

درخط

نسخهٔ ‏۱۶ مهٔ ۲۰۲۱، ساعت ۰۵:۱۹

پروتئین اتصال‌دهنده ایمونوگلوبولین (BiP) که با نام‌های (GRP-78) یا پروتئین گرماشوک 70 کیلو دالتونی 5 (HSPA5) یا (Byun1) نیز شناخته می‌شود پروتئینی است که در انسان توسط ژن HSPA5 رمزگذاری می‌شود.^[۴]^[۵]

پروتئین اتصال‌دهنده ایمونوگلوبولین یک شپرون مولکولی HSP70 است که در لومن شبکه آندوپلاسمی جای گرفته‌است و پروتئین های نوساخت را هنگام انتقال به شبکه آندوپلاسمی متصل می کند و آن‌ها را در حالت مناسب برای تاشدگی و الیگومریزاسیون بعدی حفظ می کند. پروتئین اتصال‌دهنده ایمونوگلوبولین بخشی بنیادی در ماشین آلات جابجایی است که در جابه‌جایی پس رونده پروتئین‌های نادرست از طریق غشای شبکه آندوپلاسمی که برای تخریب توسط پروتئازوم مقصد هستند، نقش دارد. پروتئین اتصال‌دهنده ایمونوگلوبولین در هر شرایط رشد یک پروتئین فراوان است، اما ساخت آن تحت شرایطی که منجر به تجمع پلی‌پپتیدهای باز نشده در شبکه آندوپلاسمی شود، به طور قابل توجهی القا می شود.

ساختار

پروتئین اتصال‌دهنده ایمونوگلوبولین شامل دو حوزه عملکردی است: حوزه اتصال نوکلئوتید (NBD) و حوزه اتصال بستر (SBD). NBD آدنوزین تری‌فسفات را متصل و هیدرولیز می کند و SBD پلی‌پپتیدها را متصل می کند.^[۶]

NBD شامل دو زیر دامنه بزرگ کروی (I و II) است که هر کدام بیشتر به دو زیر دامنه کوچک (A و B) تقسیم می شوند. زیر دامنه ها با شکافی جدا می شوند که در آن نوکلئوتید ، یک یون Mg₂ و دو یون ⁺K هر چهار حوزه (IA ، IB ، IIA ، IIB) را به هم متصل کرده و به هم پیوند می کنند.^[۷]^[۸]^[۹] SBD به دو زیر دامنه SBDβ و SBDα تقسیم می شود. SBDβ به عنوان یک جیب اتصال برای پروتئین های مشتری یا پپتید و SBDα به عنوان یک درب مارپیچ برای پوشاندن جیب اتصال عمل می کند. یک پیونددهنده میان‌دامنه‌ای NBD و SBD را به هم متصل می کند و از ایجاد رابط NBD-SBD پشتیبانی می کند.^[۱۰]^[۱۱]^[۱۲] An inter-domain linker connects NBD and SBD, favoring the formation of an NBD–SBD interface.^[۶]

منابع

↑ ^۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026864 - Ensembl, May 2017
↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Ting J, Lee AS (May 1988). "Human gene encoding the 78,000-dalton glucose-regulated protein and its pseudogene: structure, conservation, and regulation". DNA. 7 (4): 275–86. doi:10.1089/dna.1988.7.275. PMID 2840249.
↑ Hendershot LM, Valentine VA, Lee AS, Morris SW, Shapiro DN (Mar 1994). "Localization of the gene encoding human BiP/GRP78, the endoplasmic reticulum cognate of the HSP70 family, to chromosome 9q34". Genomics. 20 (2): 281–4. doi:10.1006/geno.1994.1166. PMID 8020977.
↑ ^۶٫۰ ^۶٫۱ Yang J, Nune M, Zong Y, Zhou L, Liu Q (Dec 2015). "Close and Allosteric Opening of the Polypeptide-Binding Site in a Human Hsp70 Chaperone BiP". Structure. 23 (12): 2191–203. doi:10.1016/j.str.2015.10.012. PMC 4680848. PMID 26655470.
↑ Fairbrother WJ, Champe MA, Christinger HW, Keyt BA, Starovasnik MA (Oct 1997). "1H, 13C, and 15N backbone assignment and secondary structure of the receptor-binding domain of vascular endothelial growth factor". Protein Science. 6 (10): 2250–60. doi:10.1002/pro.5560061020. PMC 2143562. PMID 9336848.
↑ Mayer MP, Bukau B (Mar 2005). "Hsp70 chaperones: cellular functions and molecular mechanism". Cellular and Molecular Life Sciences. 62 (6): 670–84. doi:10.1007/s00018-004-4464-6. PMC 2773841. PMID 15770419.
↑ Wisniewska M, Karlberg T, Lehtiö L, Johansson I, Kotenyova T, Moche M, Schüler H (2010-01-01). "Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78". PLOS ONE. 5 (1): e8625. doi:10.1371/journal.pone.0008625. PMC 2803158. PMID 20072699.
↑ Zhuravleva A, Gierasch LM (Jun 2015). "Substrate-binding domain conformational dynamics mediate Hsp70 allostery". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (22): E2865–73. doi:10.1073/pnas.1506692112. PMC 4460500. PMID 26038563.
↑ Leu JI, Zhang P, Murphy ME, Marmorstein R, George DL (Nov 2014). "Structural basis for the inhibition of HSP70 and DnaK chaperones by small-molecule targeting of a C-terminal allosteric pocket". ACS Chemical Biology. 9 (11): 2508–16. doi:10.1021/cb500236y. PMC 4241170. PMID 25148104.
↑ Liebscher M, Roujeinikova A (Mar 2009). "Allosteric coupling between the lid and interdomain linker in DnaK revealed by inhibitor binding studies". Journal of Bacteriology. 191 (5): 1456–62. doi:10.1128/JB.01131-08. PMC 2648196. PMID 19103929.

[refGRCm38Ensembl-1] ۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026864 - Ensembl, May 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid2840249-4] Ting J, Lee AS (May 1988). "Human gene encoding the 78,000-dalton glucose-regulated protein and its pseudogene: structure, conservation, and regulation". DNA. 7 (4): 275–86. doi:10.1089/dna.1988.7.275. PMID 2840249.

[pmid8020977-5] Hendershot LM, Valentine VA, Lee AS, Morris SW, Shapiro DN (Mar 1994). "Localization of the gene encoding human BiP/GRP78, the endoplasmic reticulum cognate of the HSP70 family, to chromosome 9q34". Genomics. 20 (2): 281–4. doi:10.1006/geno.1994.1166. PMID 8020977.

[Yang_2015-6] ۶٫۰ ^۶٫۱ Yang J, Nune M, Zong Y, Zhou L, Liu Q (Dec 2015). "Close and Allosteric Opening of the Polypeptide-Binding Site in a Human Hsp70 Chaperone BiP". Structure. 23 (12): 2191–203. doi:10.1016/j.str.2015.10.012. PMC 4680848. PMID 26655470.

[7] Fairbrother WJ, Champe MA, Christinger HW, Keyt BA, Starovasnik MA (Oct 1997). "1H, 13C, and 15N backbone assignment and secondary structure of the receptor-binding domain of vascular endothelial growth factor". Protein Science. 6 (10): 2250–60. doi:10.1002/pro.5560061020. PMC 2143562. PMID 9336848.

[Mayer_2005-8] Mayer MP, Bukau B (Mar 2005). "Hsp70 chaperones: cellular functions and molecular mechanism". Cellular and Molecular Life Sciences. 62 (6): 670–84. doi:10.1007/s00018-004-4464-6. PMC 2773841. PMID 15770419.

[9] Wisniewska M, Karlberg T, Lehtiö L, Johansson I, Kotenyova T, Moche M, Schüler H (2010-01-01). "Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78". PLOS ONE. 5 (1): e8625. doi:10.1371/journal.pone.0008625. PMC 2803158. PMID 20072699.

[10] Zhuravleva A, Gierasch LM (Jun 2015). "Substrate-binding domain conformational dynamics mediate Hsp70 allostery". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (22): E2865–73. doi:10.1073/pnas.1506692112. PMC 4460500. PMID 26038563.

[11] Leu JI, Zhang P, Murphy ME, Marmorstein R, George DL (Nov 2014). "Structural basis for the inhibition of HSP70 and DnaK chaperones by small-molecule targeting of a C-terminal allosteric pocket". ACS Chemical Biology. 9 (11): 2508–16. doi:10.1021/cb500236y. PMC 4241170. PMID 25148104.

[12] Liebscher M, Roujeinikova A (Mar 2009). "Allosteric coupling between the lid and interdomain linker in DnaK revealed by inhibitor binding studies". Journal of Bacteriology. 191 (5): 1456–62. doi:10.1128/JB.01131-08. PMC 2648196. PMID 19103929.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]

[۹]

[۱۰]

[۱۱]

[۱۲]