ریبونوکلئاز ۳

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary
پی‌دی‌بی	1o0wB:51-141 2a11A:41-134 1jfzA:37-121 1rc7A:37-121 1yywA:37-121 1i4sA:37-121 1rc5B:37-121 1yyoA:37-121 1yykB:37-121 1yz9A:37-121 2fflA:333-418 1u61A:10-111

ریبونوکلئاز ۳
ریبونوکلئاز ۳
	ساختار ریبونوکلئاز ۳ در حال برهم‌کنش با آران‌اِی دورشته‌ای
شناسه‌ها
نماد	RNase_III
پی‌فم	PF00636
PROSITE	PDOC00448
SCOPe	1jfz / SUPFAM
پی‌فم
ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary
پی‌دی‌بی	1o0wB:51-141 2a11A:41-134 1jfzA:37-121 1rc7A:37-121 1yywA:37-121 1i4sA:37-121 1rc5B:37-121 1yyoA:37-121 1yykB:37-121 1yz9A:37-121 2fflA:333-418 1u61A:10-111

ریبونوکلئاز ۳ (RNase III یا RNase C)^[۱] (BRENDA 3.1.26.3) نوعی ریبونوکلئاز است که آران‌ای دورشته‌ای (dsRNA) را تشخیص می‌دهد و آن را به‌طور هدفمند و در مکان‌های خاصی می‌شکند تا آن‌ها را به آران‌ای‌های بالغ تبدیل کند.^[۲] این آنزیم‌ها گروهی از اندوریبونوکلئازها هستند که با دامنهٔ ریبونوکلئاز خود مشخص می‌شوند.^[۳] آن‌ها ترکیباتی در سلول هستند که در همه‌جا حاضر هستند و در مسیرهایی مانند سنتز پیش‌ساز آران‌ای، خاموش کردن آن و مکانیسم خودتنظیمی pnp نقش اساسی دارند.^[۴]^[۵]

انواع

اَبَرخانوادهٔ ریبونوکلئاز ۳ به چهار کلاس شناخته‌شده تقسیم می‌شود: ۱، ۲، ۳ و ۴. هر کلاس با ساختار دامنهٔ خود تعریف می‌شود.^[۶]

پروتئین‌های انسانی حاوی دامنهٔ ریبونوکلئاز ۳

DICER1^[۷]
DROSHA^[۸]

منابع

↑ Filippov, Valery; Solovyev, Victor; Filippova, Maria; Gill, Sarjeet S. (7 March 2000). "A novel type of RNase III family proteins in eukaryotes". Gene. 245 (1): 213–221. doi:10.1016/S0378-1119(99)00571-5. PMID 10713462.
↑ Zamore, Phollip D. (December 2001). "Thirty-Three Years Later, a Glimpse at the Ribonuclease III Active Site". Molecular Cell. 8 (6): 1158–1160. doi:10.1016/S1097-2765(01)00418-X. PMID 11885596.
↑ Conrad, Christian; Rauhut, Reinhard (February 2002). "Ribonuclease III: new sense from nuisance". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 34 (2): 116–129. doi:10.1016/S1357-2725(01)00112-1. PMID 11809414.
↑ Inada, T.; Nakamura, Y. (1995). "Lethal double-stranded RNA processing activity of ribonuclease III in the absence of SuhB protein of Escherichia coli". Biochimie. 77 (4): 294–302. doi:10.1016/0300-9084(96)88139-9. PMID 8589060.
↑ Park, Hongmarn; Yakhnin, Helen; Connolly, Michael; Romeo, Tony; Babitzke, Paul; Gourse, R. L. (15 December 2015). "CsrA Participates in a PNPase Autoregulatory Mechanism by Selectively Repressing Translation of Transcripts That Have Been Previously Processed by RNase III and PNPase". Journal of Bacteriology. 197 (24): 3751–3759. doi:10.1128/JB.00721-15. PMC 4652041. PMID 26438818.
↑ Liang Y-H, Lavoie M, Comeau M-A, Elela SA, Ji X. Structure of a Eukaryotic RNase III Post-Cleavage Complex Reveals a Double- Ruler Mechanism for Substrate Selection. Molecular cell. 2014;54(3):431-444. doi:10.1016/j.molcel.2014.03.006.
↑ "Tissue expression of DICER1 - Summary". www.proteinatlas.org. The Human Protein Atlas. Retrieved 5 November 2016.
↑ "Tissue expression of DROSHA - Summary". www.proteinatlas.org. The Human Protein Atlas. Retrieved 5 November 2016.

[1] Filippov, Valery; Solovyev, Victor; Filippova, Maria; Gill, Sarjeet S. (7 March 2000). "A novel type of RNase III family proteins in eukaryotes". Gene. 245 (1): 213–221. doi:10.1016/S0378-1119(99)00571-5. PMID 10713462.

[2] Zamore, Phollip D. (December 2001). "Thirty-Three Years Later, a Glimpse at the Ribonuclease III Active Site". Molecular Cell. 8 (6): 1158–1160. doi:10.1016/S1097-2765(01)00418-X. PMID 11885596.

[3] Conrad, Christian; Rauhut, Reinhard (February 2002). "Ribonuclease III: new sense from nuisance". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 34 (2): 116–129. doi:10.1016/S1357-2725(01)00112-1. PMID 11809414.

[4] Inada, T.; Nakamura, Y. (1995). "Lethal double-stranded RNA processing activity of ribonuclease III in the absence of SuhB protein of Escherichia coli". Biochimie. 77 (4): 294–302. doi:10.1016/0300-9084(96)88139-9. PMID 8589060.

[pnp_Reg-5] Park, Hongmarn; Yakhnin, Helen; Connolly, Michael; Romeo, Tony; Babitzke, Paul; Gourse, R. L. (15 December 2015). "CsrA Participates in a PNPase Autoregulatory Mechanism by Selectively Repressing Translation of Transcripts That Have Been Previously Processed by RNase III and PNPase". Journal of Bacteriology. 197 (24): 3751–3759. doi:10.1128/JB.00721-15. PMC 4652041. PMID 26438818.

[Liang_Y-H_2014-6] Liang Y-H, Lavoie M, Comeau M-A, Elela SA, Ji X. Structure of a Eukaryotic RNase III Post-Cleavage Complex Reveals a Double- Ruler Mechanism for Substrate Selection. Molecular cell. 2014;54(3):431-444. doi:10.1016/j.molcel.2014.03.006.

[DICER1-7] "Tissue expression of DICER1 - Summary". www.proteinatlas.org. The Human Protein Atlas. Retrieved 5 November 2016.

[DROSHA-8] "Tissue expression of DROSHA - Summary". www.proteinatlas.org. The Human Protein Atlas. Retrieved 5 November 2016.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]