MS2 تگ کردن به روش

تگ کردن به روش MS2 در واقع تکنیکی بر پایه میانکنشهای طبیعی پروتئین پوششی که باکتریوفاژ MS2 را در بر می‌گیرد، با ساختار حلقه-ساقه(stem-loop) از ژنوم فاژی است^[۱] که در جهت تخلیص بیوشیمیایی کمپلکسهای RNA-Protein می‌باشد. همچنین جهت تشخیص RNA در سلولهای زنده می‌توان آن را با GFP یا همان Green florescent protein کونژگه کرد و استفاده نمود.^[۲] اخیراً از این تکنیک در جهت مانیتور کردن حضور RNA در سلول زنده، در محل رونویسی یا به صورت ساده‌تر بررسی تغییرات در تعداد RNAهای سیتوپلاسم استفاده کرده‌اند.^[۳]^[۴]تحقیقات نشان داده‌اند که بیان در سلولهای پروکاریوتی و یوکاریوتی به صورت منقطع و انفجاری رخ می‌دهد که فواصل میان آنها نامنظم می‌باشد.

Rna تک رشته‌ای است که از روی DNA که در هستهٔ سلول‌ها است کپی شده‌است.

فرایند[ویرایش]

با ساخت یک RNA و الگویی را برای آن طراحی می‌کنیم که تشکیل یک ساختار حلقه-ساقه دهد. این عمل را با اضافه کردن کپی‌هایی از توالی MS2 متصل شونده به RNA را در بخش‌های غیر کد کننده آغاز می‌کنیم.^[۵]

منابع[ویرایش]

↑ Johansson HE, Liljas L, Uhlenbeck OC (1997). "RNA recognition by the MS2 phage coat protein". Sem Virol. 8 (3): 176–185. doi:10.1006/smvy.1997.0120.
↑ Bertrand E, Chartrand P, Schaefer M, Shenoy SM, Singer RH, Long RM (October 1998). "Localization of ASH1 mRNA particles in living yeast". Molecular Cell. 2 (4): 437–45. doi:10.1016/s1097-2765(00)80143-4. PMID 9809065.
↑ Golding I, Paulsson J, Zawilski SM, Cox EC (December 2005). "Real-time kinetics of gene activity in individual bacteria". Cell. 123 (6): 1025–36. doi:10.1016/j.cell.2005.09.031. PMID 16360033.
↑ Chubb JR, Trcek T, Shenoy SM, Singer RH (May 2006). "Transcriptional pulsing of a developmental gene". Current Biology. 16 (10): 1018–25. doi:10.1016/j.cub.2006.03.092. PMID 16713960.
↑ "Live and In Color | The Scientist Magazine®". The Scientist. Retrieved 2017-03-12.

[1] Johansson HE, Liljas L, Uhlenbeck OC (1997). "RNA recognition by the MS2 phage coat protein". Sem Virol. 8 (3): 176–185. doi:10.1006/smvy.1997.0120.

[2] Bertrand E, Chartrand P, Schaefer M, Shenoy SM, Singer RH, Long RM (October 1998). "Localization of ASH1 mRNA particles in living yeast". Molecular Cell. 2 (4): 437–45. doi:10.1016/s1097-2765(00)80143-4. PMID 9809065.

[3] Golding I, Paulsson J, Zawilski SM, Cox EC (December 2005). "Real-time kinetics of gene activity in individual bacteria". Cell. 123 (6): 1025–36. doi:10.1016/j.cell.2005.09.031. PMID 16360033.

[4] Chubb JR, Trcek T, Shenoy SM, Singer RH (May 2006). "Transcriptional pulsing of a developmental gene". Current Biology. 16 (10): 1018–25. doi:10.1016/j.cub.2006.03.092. PMID 16713960.

[:0-5] "Live and In Color | The Scientist Magazine®". The Scientist. Retrieved 2017-03-12.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]