پدوباکتر
Appearance
Pedobacter | |
---|---|
ردهبندی علمی | |
فرمانرو: | Bacteria |
شاخه: | Bacteroidetes |
رده: | Sphingobacteria |
راسته: | Sphingobacteriales |
تیره: | Sphingobacteriaceae |
سرده: | Pedobacter |
پدوباکتر یک سرده از باکتریهای گرم منفی و باکتریهای همراه با خاک است. گونههای آن از جمله پدوباکتر هپارینوس که قبلاً با نام فلاووباکتریوم هپارینوم شناخته میشد، هپاریناز تولید میکند و قادر به استفاده از هپارین به عنوان تنها منبع کربن و نیتروژن است.[۱]
در زیستشناسی مولکولی نیز، پدوباکتر به عنوان یکی از آلایندههای معرفهای کیت استخراج DNA و سیستمهای فوق-خالص آب است که ممکن است منجر به ظاهر غلط اندازش در ریزاندامگان همزیست یا مجموعه دادههای متاژنومیکس شود.[۲]
گونه ها[ویرایش]
- پدوباکتر آفریکانوس
- پدوباکتر آگری
- پدوباکتر آلوویونیس
- پدوباکتر آرکتیکوس
- پدوباکتر بورئالیس
- پدوباکتر کریوکونیتیس
- پدوباکتر جینسنجیزولی
- پدوباکتر هپارینوس
- پدوباکتر اینسولا
- پدوباکتر ججوئنسیس
- پدوباکتر لنتوس
- پدوباکتر نیاکنسیس
- پدوباکتر ریزوسفرا
- پدوباکتر سالتانس
- پدوباکتر سولی
- پدوباکتر تریکولا
منابع[ویرایش]
- ↑ Shaya, D (2006). "Crystal structure of heparinase II from Pedobacter heparinus and its complex with a disaccharide product". J. Biol. Chem. 281: 15525–35. doi:10.1074/jbc.m512055200. PMID 16565082.
- ↑ Salter, S; Cox, M; Turek, E; Calus, S; Cookson, W; Moffatt, M; Turner, P; Parkhill, J; Loman, N; Walker, A (2014). "Reagent contamination can critically impact sequence-based microbiome analyses". bioRxiv. doi:10.1101/007187.
برای خواندن بیشتر[ویرایش]
- Kook, MooChang; Park, YongJin; Yi, Tae-Hoo (2014). "Pedobacter jejuensis sp nov., isolated from soil of a pine grove, and emended description of the genus Pedobacter". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 64 (Part 5): 1789–1794. doi:10.1099/ijs.0.058024-0. PMID 24573158. Archived from the original on 12 November 2014. Retrieved 12 November 2014.