پرونده:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

تفکیک‌پذیری بالاتری در دسترس نیست.

Phylogenetic_tree_of_coronaviruses.jpg ‏(۵۷۱ × ۴۵۱ پیکسل، اندازهٔ پرونده: ۷۵ کیلوبایت، نوع MIME پرونده: image/jpeg)

این پرونده در ویکی‌انبار موجود است. محتویات صفحهٔ توصیف آن در زیر نمایش داده می‌شود.
ویکی‌انبار مخزن پرونده‌های رسانه‌ای آزاد است. شما هم می‌توانید کمک کنید.

خلاصه

توضیحPhylogenetic tree of coronaviruses.jpg	English: Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. Bootstrap values were calculated from 1000 trees. 1118 amino acid positions in Pol were included. The scale bar indicates the estimated number of substitutions per 20 amino acids. All abbreviations for the coronaviruses were the same as those in Figure 1.
تاریخ	‏۲۴ اوت ۲۰۱۰‏
منبع	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/
پدیدآور	Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen

اجازه‌نامه

این پرونده با اجازه‌نامهٔ کریتیو کامانز Attribution 3.0 بومی نشده منتشر شده است.

شما اجازه دارید:

برای به اشتراک گذاشتن – برای کپی، توزیع و انتقال اثر
تلفیق کردن – برای انطباق اثر

تحت شرایط زیر:

انتساب – شما باید اعتبار مربوطه را به دست آورید، پیوندی به مجوز ارائه دهید و نشان دهید که آیا تغییرات ایجاد شده‌اند یا خیر. شما ممکن است این کار را به هر روش منطقی انجام دهید، اما نه به هر شیوه‌ای که پیشنهاد می‌کند که مجوزدهنده از شما یا استفاده‌تان حمایت کند.

تاریخچهٔ پرونده

روی تاریخ/زمان‌ها کلیک کنید تا نسخهٔ مربوط به آن هنگام را ببینید.

	تاریخ/زمان	بندانگشتی	ابعاد	کاربر	توضیح
کنونی	‏۷ مارس ۲۰۲۰، ساعت ۰۲:۴۲		۵۷۱ در ۴۵۱ (۷۵ کیلوبایت)	Guest2625	Uploaded a work by Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/ with UploadWizard

کاربرد پرونده

صفحهٔ زیر از این تصویر استفاده می‌کند:

کروناویروس

کاربرد سراسری پرونده

ویکی‌های دیگر زیر از این پرونده استفاده می‌کنند:

کاربرد در bn.wikipedia.org
- করোনাভাইরাস
کاربرد در en.wikipedia.org
- Coronavirus
کاربرد در fr.wikipedia.org
- Coronavirus
کاربرد در ig.wikipedia.org
- Nje Korona
کاربرد در sq.wikipedia.org
- Koronavirusi
کاربرد در su.wikipedia.org
- Koronavirus

فراداده

این پرونده حاوی اطلاعات اضافه‌ای‌است که احتمالاً دوربین دیجیتال یا پویشگری که در ایجاد یا دیجیتالی‌کردن آن به کار رفته آن را افزوده است. اگر پرونده از وضعیت ابتدایی‌اش تغییر داده شده باشد آنگاه ممکن است شرح و تفصیلات موجود اطلاعات تصویر را تماماً بازتاب ندهد.

عنوان تصویر	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
تصویربردار/هنرمند	Patrick C. Y. Woo
عنوان کوتاه	Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis
توضیحات پرونده JPEG	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
واژه‌های کلیدی	coronavirus genome bioinformatics

پرونده:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

خلاصه

اجازه‌نامه

عنوان

آیتم‌هایی که در این پرونده نمایش داده شده‌اند

توصیف‌ها

درخت فیلوژنتیک

وضعیت کپی‌رایت

حق تکثیر محفوظ شده

اجازه‌نامه

Creative Commons Attribution 3.0 Unported ^{انگلیسی}

تاریخ ساخت / تأسیس

۲۴ اوت 2010

نوع رسانهٔ اینترنتی

image/jpeg

تاریخچهٔ پرونده

کاربرد پرونده

کاربرد سراسری پرونده

فراداده

خلاصه

اجازه‌نامه

عنوان

آیتم‌هایی که در این پرونده نمایش داده شده‌اند

توصیف‌ها

درخت فیلوژنتیک

وضعیت کپی‌رایت

حق تکثیر محفوظ شده

اجازه‌نامه

Creative Commons Attribution 3.0 Unported انگلیسی

تاریخ ساخت / تأسیس

۲۴ اوت 2010

نوع رسانهٔ اینترنتی

image/jpeg

تاریخچهٔ پرونده

کاربرد پرونده

کاربرد سراسری پرونده

فراداده

Creative Commons Attribution 3.0 Unported ^{انگلیسی}

تاریخ ساخت / تأسیس