جی‌مول

Jmol

نمایی از مولکول طراحی شده در فضای سه بعدی توسط برنامه جی‌مل
توسعه‌دهنده(ها)	تیم طراحی و توسعه جی‌مل
انتشار پایدار	۱۲٫۲.۲۴
انتشار آزمایشی	۱۲٫۲.۲۳
مخزن	sourceforge.net/p/jmol/code/HEAD/tree/
نوشته‌شده با	جاوا
سیستم‌عامل	چندسکویی
پروانه	گنو ال‌جی‌پی‌ال
وبگاه	www.jmol.org و wiki.jmol.org

جی‌مُل (به انگلیسی: Jmol) نرافزاری تحت متن‌باز و نوشته شده در جاوا برای نمایش ساختار سه‌بعدی ملکول‌های شیمیایی که نیازی به تقویت کننده‌های سه‌بعدی برای کامپیوترهای شخصی ندارد. جی‌مل ساختار فیزیکی ملکول‌ها را به حالت سه‌بعدی و قابل درک تبدیل می‌کند که در آموزش، مطالعات و تحقیقات علمی و حتی خطرناک همچون آزمایش‌های شیمیایی کاربردی وسیع دارد. این نرم‌افزار که در زبان برنامه نویسی جاوا نوشته شده در سیستم عامل‌های ویندوز، مکیناتش اواس، لینوکس و یونیکس قابل اجرا می‌باشد.

اجازه نامه این برنامه زیر نظر نرم‌افزار آزاد و متن‌باز است. مستقل بودن و قابلیت توسعه و به‌روز رسانی این نرم‌افزار مهم بوده و نیز امکان یکپارچه شدن با دیگر نرم‌افزارهای جاوا همچون بیوکلیپس و تاورنا را دارد.

یکی از قابلیت‌های محبوب آن وجود برنامکی است که امکان اجرای ملکول‌های طراحی شده در برنامه را در صفحه‌های اینترنتی به روش‌های مختلف امکان پذیر می‌کند. به عنوان مثال ملکول‌ها را می‌توان به صورت "توپ و چوب"، "فضای پر شده"، "روبانی" و غیره به نمایش درآورد. جی‌مل از قالب پرونده‌های ملکولی نیز پشتیبانی می‌کند از جمله بانک اطلاعات پروتوئین‌ها (pdb)، فایل اطلاعات کریستالوگرافی (cif)، جدول فایل‌های شیمیایی (mol) و زبان نشانه‌گذاری شیمیایی (cml).

جی‌مل نیازمند نصب اولیه جاوا بر روی هر سیستم مکمل اجرایی می‌باشد. به طور مثال جی‌مل با مرورگرهای موزیلا فایرفاکس، اینترنت اکسپلورر، اپرا، گوگل کروم و سافاری سازگاری کامل دار.

نماگرفت

• 
  ساختار نوعی کریستال
• 
  نمایش دو شاخه از نمک موجود در هموگلوبین
• 
  یوباکتریال ۷۰اس ریبوزوم

منابع

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «Jmol». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی.

پیوند به بیرون

• وب‌گاه رسمی